内容正文:
第3章 基因工程
第2节 基因工程的基本操作程序
(第2课时)
①PCR利用了 原理,通过调节 来控制DNA双链的解聚与结合,PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器。
【探究·实践一】利用PCR在体外进行DNA片段扩增
1. 实验原理
变性
90˚C
延伸
72˚C
复性
50˚C
PCR(扩增)仪
DNA的热变性
温度
②PCR扩增DNA片段还利用了 ,
的原理。一次PCR一般要经历 次循环。
DNA
半保留复制
30
【探究·实践一】利用PCR在体外进行DNA片段扩增
2. 材料用具
PCR仪
1
微量离心管
2
微量移液器
4
一次性
吸液枪头
5
离心机
3
自动控温,实现DNA的扩增
实际上是进行PCR反应的场所
分离组分
微量移液器每吸取一种试剂后,需更换枪头
用于向微量离心管转移PCR配方中的液体
调节旋钮
推动杆
体积刻度
吸液杆
枪头
卸枪头
按钮
【探究·实践一】利用PCR在体外进行DNA片段扩增
2. 材料用具
10倍浓缩的扩增缓冲液 5 μL
20 mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液 1 μL
20 μmol/L的引物Ⅰ 2.5 μL
20 μmol/L的引物Ⅱ 2.5 μL
H2O 28~33 μL
1~5 U/μL的Taq DNA聚合酶 1~2 U
模板DNA 5~10 μL
总体积 50 μL
PCR反应体系的配方
6
注:模板DNA的用量为1gp~1μg
①酶和缓冲液要在冰块上缓慢融化,用后置于-20℃冰箱中保存。
②实验所需材料可以直接从公司购买,酶和缓冲液一般分装成小份,避免反复融化导致活性降低甚至失活。
【探究·实践一】利用PCR在体外进行DNA片段扩增
3. 方法步骤
(1)加样:
用微量移液器按照右栏中的配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分。
(2)离心:
待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子,将微量离心管放入离心机里,离心约10s,使反应液集中在离心管的底部。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃,5min
30次 94℃,30s 55℃,30s 72℃,1min
最后1次 94℃,1min 55℃,30s 72℃,1min
【探究·实践一】利用PCR在体外进行DNA片段扩增
3. 方法步骤
(3)反应:
参照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
1. 预变性的目的是什么?
使DNA充分变性,双链打开,以利于引物更好地和模板结合
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃,5min
30次 94℃,30s 55℃,30s 72℃,1min
最后1次 94℃,1min 55℃,30s 72℃,1min
【探究·实践一】利用PCR在体外进行DNA片段扩增
3. 方法步骤
(3)反应:
参照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
2. 为什么最后1次变性和延伸时间都延长了?
Taq DNA聚合酶活性会随着循环次数增加而下降。在每一轮循环中,部分片段可能没有完全延伸完,Taq DNA聚合酶就脱落了。最后1次变性、延伸时间延长,让这些DNA打开,重新充分延伸。
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
1. 实验原理
①电泳:DNA分子具有 ,在一定的 下,这些基团可以带上正电荷或负电荷,在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷 的电极移动,这个过程就是电泳。
可解离的基团
pH
相反
一般使用的电泳缓冲液pH=8,DNA分子带负电荷,在电场中DNA便向 泳动。
正极
磷酸电离形成的磷酸基团带负电
3. 如何鉴定PCR的产物?
琼脂糖凝胶电泳
③在凝胶中DNA分子的迁移速率与
、 和
等有关。
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
1. 实验原理
②PCR的产物一般通过 ,
来鉴定。
琼脂糖凝胶
电泳
凝胶的浓度
电极
电极
缓冲液
电泳槽
琼脂糖
电泳胶
电极
DNA分子的大小
构象
DNA琼脂糖凝胶
琼脂糖的微结构
④核酸染色剂:
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
1. 实验原理
常用的核酸染色剂有EB(溴化乙锭)、GoldView等,EB能插入DNA分子中的碱基对之间,导致EB与DNA结合。嵌入核酸碱基间的EB能吸收300nm波长的紫外光,发出可见荧光。其荧光强度与DNA分子的含量成正比。
⑤标准参照物(Marker):
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
1. 实验原理
DNA Marker是 的片段,在实验时和样本DNA同时进行凝胶电泳,通过对比两者的迁移速率,可以大致估计 ,
。
已知的DNA分子大小
样本DNA
的大小
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
2. 实验器材
琼脂糖凝胶电泳装置
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
3. 方法步骤
①熔化:
电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
制备凝胶
进行电泳
观察鉴定
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
3. 方法步骤
②倒模:
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
③凝固:
待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
制备凝胶
进行电泳
观察鉴定
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
3. 方法步骤
①加液:
将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
制备凝胶
进行电泳
观察鉴定
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
3. 方法步骤
②加样:
扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物(Marker)。
制备凝胶
进行电泳
观察鉴定
16
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
3. 方法步骤
③电泳:
制备凝胶
进行电泳
观察鉴定
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳。
17
【探究·实践二】利用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR的产物
3. 方法步骤
制备凝胶
进行电泳
观察鉴定
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
Q1:PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前应如何处理?
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
为避免外源DNA等因素的污染,这些材料用具必须进行高压灭菌处理
一定要戴好一次性手套
Q2:在进行整个实验操作过程中,操作者的手要进行什么处理?
一条条带(目的基因片段)
Q3:本实验进行电泳鉴定的结果应该是几条条带?
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
750bp
Q4:如图所示,该片段大小约为 。
Q5:判断成功扩增出DNA片段的依据是什么?
可以通过在紫外灯下直接观察DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。
0次
12次
12次
30次
30次
Marker
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
Q6:进行电泳鉴定的结果是只有Marker具有条带,为什么?
目的基因扩增不成功
Q7:目的基因扩增不成功,可能有哪些原因?
①漏加了PCR的反应成分;
②各反应成分的用量不当;
③PCR程序设置不当;
④Taq DNA聚合酶失活;
⑤变性时温度低,变性时间短,模板DNA链未打开
①引物设计不合理,它们与非目的序列有同源性或容易形成二聚体;
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
Q8:进行电泳鉴定的结果是不止一条条带,为什么?
出现非特异性扩增带
Q9:出现非特异性扩增带,可能有哪些原因?
②复性时的温度过低,引物随机连接到非目的基因片段;
③DNA聚合酶的质量不好
课堂小测
4、关于采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR 产物的实验,下列叙述正确的是( )
A. 琼脂糖凝胶浓度的选择需考虑待分离DNA片段的大小
B. 凝胶载样缓冲液中指示剂的作用是指示DNA分子的具体位置
C. 在同一电场作用下,DNA 片段越长,向负极迁移速率越快
D. 琼脂糖凝胶中的 DNA分子可在紫灯下被检测出来
A
课堂小测
5、构建基因表达载体是基因工程的核心步骤。可通过琼脂糖凝胶电泳检测酶切片段长度,初步判断基因表达载体是否构建成功。下图是用限制酶完全酶切后(不考虑相同 DNA 之间的连接和目的基因的自身环化)的电泳结果。下列叙述错误的是( )
A. 琼脂糖凝胶中的DNA分子可以在特定波长的紫外灯照射下被检测出来
B. 酶切后,相同条件下 DNA分子越小,在凝胶中的迁移速率越快
C. 泳道1为单酶切空载体后的产物,
泳道2为单酶切重组载体后的产物
D. 泳道3为双酶切重组载体后的产物,
且目的基因与载体正确连接
D
Lavf58.29.100
Packed by Bilibili XCoder v2.0.2
Lavf58.20.100
Packed by Bilibili XCoder v2.0.2
$