内容正文:
基因工程的高考高频考点——引物
【错题讲评】
考向一:引物的书写
第一步:确定引物的位置
引物与模板链的3‘端反向结合
第二步:书写引物序列
①先看题目要求(要求写出几个碱基就写几个,没有要求的就把“暴露出来”的都写了)
②再通过碱基互补配对原则进行书写
【快速书写策略,“照抄”非模板链序列】
【必背积累】-OH端是3‘端,磷酸基团端是5‘端。
例1.(2023·重庆·高考真题)某小组通过PCR(假设引物长度为8个碱基短于实际长度)获得了含有目的基因的DNA片段,并用限制酶进行酶切(下图),再用所得片段成功构建了基因表达载体。下列叙述错误的是( )
A.其中一个引物序列为5'TGCGCAGT-3'
B.步骤①所用的酶是SpeI和CfoI
C.用步骤①的酶对载体进行酶切,至少获得了2个片段
D.酶切片段和载体连接时,可使用E.coli连接酶或T4连接酶
B错误
考向一:一般的引物书写
A.其中一个引物序列为5‘TGCGCAGT-3’(√)
【变式】另外一个引物序列为 。
5‘AGCTAGCA-3’
第一步:确定引物的位置
引物与模板链的3‘端反向结合
第二步:书写引物序列
①先看题目要求(要求写出几个碱基)
②再通过碱基互补配对原则进行书写
【快速书写策略,“照抄”非模板链序列】
5
【题型补充】“反推”限制酶的选择
第一步:将剪切后的黏性末端“补全”为双链
B.步骤①所用的酶是SpeI和CfoI(×)
第二步:将“切口”标注出来
第三步:代入题干给出的限制酶序列,进行“验证”
考向二:添加限制酶识别序列的引物书写
例2.(2022·山东,25节选) 为使PCR产物能被限制酶切割,需在引物上添加相应的限制酶识别序列,该限制酶识别序列应添加在引物的________(填“3′端”或“5′端”)。
5′端
[解析]DNA聚合酶延伸时,是将脱氧核苷酸加到引物的3′端,为了不破坏目的基因,该限制酶识别序列应添加在引物的5′端。
若引物需被修饰,如增加限制酶的识别序列,这样的题目中引物该如何书写?
例3.为使目的基因与质粒连接,在设计PCR引物
扩增Ers1基因时需添加限制酶XhoⅠ(识别序列为
5′—CTCGAG—3′)
的识别序列。已知Ers1基因左端①处的碱基序列
为—TTCCAATTTTAA—,则其中一种引物设计
的序列是5′______________________________3′。
—CTCGAGTTCCAATTTTAA—
考向一:一般的引物书写
【建立解题思路】
第一步:确定引物的位置,引物与模板链的3‘端反向结合。
第二步:书写引物序列
①先看题目要求,确定书写碱基的数量
要求写出几个碱基就写几个,没有要求的就把“暴露出来”的都写了
②再通过碱基互补配对原则进行书写
【快速、准确书写策略,“照抄”非模板链序列】
【必背】-OH端是3‘端,磷酸基团端是5‘端。
考向二:添加限制酶识别序列的引物书写
①遵循上述步骤、方法不变,先写出对应序列;
②在已经写出的序列的5‘端,延长一段,此段“照抄”酶的识别序列( 5‘ → 3‘ )
【学情检测】
1. 如图为X蛋白的部分基因序列,所示序列为引物结合的部分,据图分析:
扩增X蛋白基因所需的引物序列是________________________________________;__________________________________。
5′-ATGCCGTAAGTCCTAC-3′
5′-TGATCTACGGCTTACA-3′
2大豆中转录调控因子Y蛋白可以和某些基因启动子序列结合,促进其表达以增强大豆对干旱和盐胁迫的抗性。研究人员通过逆转录获得Y基因并将其下游终止密码子对应序列剔除,然后与载体上绿色荧光蛋白基因(GFP)进行拼接获得融合基因。成功表达的Y-GFP融合蛋白可用于Y蛋白调控机理的研究。研究中首先要对Y基因进行PCR扩增。PCR反应要在一定的缓冲液中进行,缓冲液中一般需要加入Mg2+,其原因是______________________________。
DNA聚合酶需要Mg2+激活
如图所示Y基因序列为转录的____________(填“模板链”或“非模板链”)。
非模板链
已知EcoRⅠ识别序列为5′-GAATTC-3′,BamHⅠ识别序列为5′-GGATCC-3′,这些限制酶识别序列不影响融合蛋白基因的表达。为使Y基因正确接入载体并成功表达出Y-GFP融合蛋白,Y基因下游扩增引物应为5′-__________________-3′(包括添加的限制酶识别序列,共写12个碱基)。
GGATCCATGTTC
【错题讲评】
考向三:反向PCR中引物的选择
1
3
2
4
分析:选择引物1、4,与选择引物2、3的扩增结果是否相同?
【归纳】一对引物
其模板链是不同的
其方向是反向的
【归纳】反向PCR的常考要点
1、目的:通过环化,用已知序列的引物扩增出未知的序列
2、步骤:酶切 → 环化 → 引物设计 → PCR → 测序
使用:限制性核酸内切酶(限制酶)
注:该酶不可以破坏已知序列
使用:DNA连接酶
①引物是根据已知序列设计的
②选择1对反向引物,二者“背对背”
【学情检测】1.常见PCR只能扩增两引物之间的DNA序列,要扩增已知DNA序列两侧的未知DNA序列,可用反向PCR技术。反向PCR技术扩增的原理如图所示。下列叙述错误的是
A.酶切阶段,L中不能含有酶切
时所选限制酶的识别序列
B.环化阶段,可选用E.coli DNA
连接酶或T4 DNA连接酶
C.图中引物,应选择引物1和引物4,且二者间不能互补配对
D.PCR扩增,将温度调至72 ℃的目的是使引物与模板链结合
√
【学情检测】2.(2020·江苏·高考真题)如果已知一小段DNA的序列,可采用PCR的方法,简捷地分析出已知序列两侧的序列,具体流程如下图(以EcoR I酶切为例):
请据图回答问题:
(1)步骤I用的EcoR I是一种 酶,它通过识别特定的 切割特定位点。
(2)步骤Ⅱ用的DNA连接酶催化相邻核苷酸之间的3′-羟基与5′-磷酸间形成 ;PCR循环中,升温到95℃是为了获得 ;TaqDNA聚合酶的作用是催化 。
【答案】
(1)限制性核酸内切(或限制) 核苷酸序列
(2)磷酸二酯键 DNA单链
以DNA为模板的DNA链的延伸
(3)若下表所列为已知的DNA序列和设计的一些PCR引物,步骤Ⅲ选用的PCR引物必须是 (从引物①②③④中选择,填编号)。
名称 DNA序列(省略号处省略了部分核苷酸序列)
已知
序列 5′-AACTATGCGCTCATGA……GCAATGCGTAGCCTCT-3′
3′-TTGATACGCGAGTACT……CGTTACGCATCGGAGA-5′
引物 ①5′-AACTATGCGCTCATGA-3′
②5′-GCAATGCGTAGCCTCT-3′
③5′-AGAGGCTACGCATTGC-3′
④5′-TCATGAGCGCATAGTT-3′
②④
(4)对产物测序,经分析得到了片段F的完整序列。下列单链序列中(省略号处省略了部分核苷酸序列),
结果正确的是______。
A.5′-AACTATGCG……AGCCCTT-3′
B.5′-AATTCCATG……CTGAATT-3′
C.5′-GCAATGCGT……TCGGGAA-3′
D.5′-TTGATACGC……CGAGTAC-3′
B
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