内容正文:
专题6赋予生物新的遗传特性的基因工程
第3讲:相关实验
1. 的粗提取与鉴定
(1)实验原理
蛋白质
二苯胺
蓝
无色
实验组
空白对照组
变蓝
不变蓝
【拓展】反复地溶解与析出DNA,能够去除杂质?
1、用高盐浓度的溶液溶解DNA,能除去在高盐溶液中不能溶解的杂质;
2、用低盐溶液使DNA析出,能除去溶解在低盐溶液中的杂质。
因此,通过反复溶解与析出DNA,就能够除去与DNA溶解度不同的多种杂质,得到纯度较高的DNA 。
2
选材原则:DNA含量高、材料易得、便于提取、新鲜的材料
不能用哺乳动物成熟的红细胞作为实验材料,原因是哺乳动物成熟的红细胞无细胞核(无 ),可选用鸡血细胞作为材料
注意1:选材不能选择哺乳动物成熟的红细胞,因为哺乳动物成熟的红细胞中没有细胞核和线粒体,几乎不含DNA。
注意2:以血液(如鸡血细胞,有细胞核)为实验材料时,每100 mL血液中需要加入3 g柠檬酸钠(抗凝剂),防止血液凝固。
注意3:久置的实验材料、DNA易被降解,实验现象不明显。
注意4:可以选择菠菜等绿色的实验材料。
(2)方法步骤(以洋葱为例)
(1)制备研磨液
(2)提取上清液
(3)DNA的析出
(4)DNA的鉴定
(2)方法步骤(以洋葱为例)
防止DNA降解
离心
或
可以向上清液中加入嫩肉粉(含木瓜蛋白酶),
并在适宜温度的水浴中加热以加快反应,促使部分蛋白水解。
(1)制备研磨液
(2)提取上清液
(3)DNA的析出
(4)DNA的鉴定
(2)方法步骤(以洋葱为例)
预冷的 95% 酒精
或
[易错提醒] 加入酒精和用玻璃棒搅拌时,动作要沿着一个方向、轻缓搅拌,以免加剧 分子的断裂,导致 分子不能形成丝状物
(1)制备研磨液
(2)提取上清液
(3)DNA的析出
(4)DNA的鉴定
提示:应注意观察提取到的DNA颜色,如果不是白色丝状物,说明DNA中的杂质较多
杂质可能是核蛋白、多糖等。
析出DNA
(草莓)
由于玻璃表面带电荷,DNA易被吸附于玻璃表面,故实验中应尽量不使用或少使用玻璃器皿,且玻璃棒不能直插烧杯底部。
(1)制备研磨液
(2)提取上清液
(3)DNA的析出
(4)DNA的鉴定
(2)方法步骤(以洋葱为例)
二苯胺
变蓝
注意:
①需要进行对照实验
实验组:加入等量的2mol/L的NaCl并加入丝状物或沉淀物。
对照组:加入一定量的2mol/L的NaCl溶液
实验组
空白对照组
②需要水浴加热,才会出现现象
③冷却后观察,现象更稳定
+4ml二苯胺试剂
+4ml二苯胺试剂
变蓝
不变蓝
未冷却
冷却5分钟后
现象明显
现象不明显
现象明显
【归纳总结】
归纳法分析各步骤的原理或目的
步骤 原理或目的
充分研磨 使细胞破碎,DNA溶解于研磨液中
过滤
(或离心) 除去细胞膜等不溶杂质,得到与蛋白质等杂质结合在一起的溶解于滤液(或上清液)的DNA
搅拌(或离心)析出DNA 加入预冷的酒精溶液,蛋白质溶于酒精,DNA不溶于酒精,将DNA和蛋白质等杂质分离
溶解 用2 mol/L的NaCl溶液溶解DNA
鉴定DNA 二苯胺试剂现配现用,水浴加热,溶液变蓝色则证明有DNA存在
2024山东 13·关于“DNA的粗提取与鉴定”实验,下列说法正确的是( )
A.整个提取过程中可以不使用离心机
B.研磨液在 4℃冰箱中放置几分钟后,应充分摇匀再倒入烧杯中
C.鉴定过程中 DNA双螺旋结构不发生改变
D.仅设置一个对照组不能排除二苯胺加热后可能变蓝的干扰
【答案】A【解析】A、在 DNA的粗提取与鉴定实验中,可将获得的研磨液用纱布过滤后,在 4℃的冰箱中放置几分钟,再取上清液,也可以直接将研磨液用离心机进行离心后取上清液,A正确;B、研磨液在 4℃冰箱中放置几分钟后,DNA在上清液中,应取上清液倒入烧杯中,B错误;C、鉴定过程中用沸水浴加热,DNA双螺旋结构会发生改变,C错误;D、加入二苯胺试剂后沸水浴处理的时间要在 5分钟以上,且要等到冷却后再观察结果,这样才可以观察到较为明显的显色反应,仅设置一个对照组可以排除二苯胺加热后可能变蓝的干扰,D错误。
若实验材料是鸡血呢?
防止血液凝固
第一步:制备鸡血细胞
获取鸡血 加入抗凝剂(如:柠檬酸钠) 离心 获取鸡血细胞
第二步:破碎细胞,释放核物质
使细胞吸水胀破,释放核物质。
第三步:溶解核内DNA,析出DNA
2mol/L
NaCl溶液
C是蒸馏水
第四步:再次溶解核内DNA,析出DNA
【细节】此实验过程中有几次使用蒸馏水?几次析出DNA?几次用到NaCl溶液?
两次使用蒸馏水
两次析出DNA
三次用到NaCl溶液
次数 目的
第一次 使鸡血细胞吸水涨破
第二次 稀释NaCl溶液,使DNA逐渐析出
次数 方法
第一次 加蒸馏水,降低NaCl的浓度,从而降低DNA的溶解度,使DNA析出。
第二次 加95%的冷酒精,DNA不溶于酒精,使DNA析出。
次数 目的
第一次 溶解DNA,析出蛋白质等杂质
第二次 使DNA再溶解,为了获得含杂质较少的DNA
第三次 溶解DNA,以便DNA与二苯胺反应,用于DNA的鉴定。
2. 片段的扩增及电泳鉴定
(1)原理
原理:的热变性原理,即通过调节温度来控制 双链的解聚与结
合。
(2)PCR实验操作步骤
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PCR实验操作步骤
微量移液器
底部
离心管
按照加入体积的大小,由大到小依次加入各试剂,即先加入无菌水。为保护酶的活性,一般最后加入耐高温的DNA聚合酶
提高反应速率
PCR实验操作步骤
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 940C,5min
30 次 940C, 30s 550C, 30s 720C,1min
最后一次 940C,1min 550C, 30s 720C,10min
思考:1.预变性的目的是什么?
2.为什么最后1次变性时间延长?
3.最后一次循环通常在72℃维持10分钟,目的是什么?
使DNA充分变性,双链打开,以利于引物更好地和模板结合
Taq DNA聚合酶活性会随着循环次数增加而下降。
在每一轮循环中,部分片段可能没有完全延伸完,Taq DNA聚合酶就脱落了。最后1次变性时间延长,让这些DNA打开,重新延伸。
使子链充分延伸。
如何知道是否扩增出了目的基因片段?
②电泳
带电分子
大小和构象
高凝胶浓度,孔隙小,分辨较小的DNA分子迁移速率减慢
低凝胶浓度,孔隙大,有助于迁移速率的提高,可能不足以分辨较小的DNA片段
环状、链状等
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配制琼脂糖溶液
制备凝胶
加样
电泳、观察
琼脂糖凝胶电泳过程:
根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%-1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
作用:维持相对稳定的ph条件,并保护DNA
作用:使DNA在紫外灯照射下发光,便于观察现象
配制琼脂糖溶液
制备凝胶
加样
电泳、观察
琼脂糖凝胶电泳过程:
根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%-1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
作用:维持相对稳定的ph条件,并保护DNA
作用:使DNA在紫外灯照射下发光,便于观察现象
倒入凝胶
加入梳子形成加样孔,凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,将电泳缓冲液加入电泳槽中
①加入PCR产物与
凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,
②留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物(Marker)。
配制琼脂糖溶液
制备凝胶
加样
电泳、观察
琼脂糖凝胶电泳过程:
有颜色肉眼可见,可显示电泳的进程
增加样品密度,使DNA沉入加样孔底部
原理:凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300纳米的紫外灯下被检测出来。
①加入PCR产物与
凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,
②留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物(Marker)。
配制琼脂糖溶液
制备凝胶
加样
电泳、观察
接通电源,等待电泳,待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳。取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
有颜色肉眼可见,可显示电泳的进程
琼脂糖凝胶电泳过程:
【笔记】成功扩增出DNA片段的判断依据是:
紫外灯下直接观察到DNA条带的
① (代表扩增产物的类型);
② (代表扩增产物量的多少)。
实验:DNA片段的扩增及电泳鉴定
结果
如图所示:
进行电泳鉴定的结果为 条条带,该片段大小约为 bp(碱基对)。
一
750
分布
亮度
DNA分子越大,
迁移速度越慢。
实验:DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.如果扩增失败没有条带(即未出现扩增条带),分析其可能原因:
① 失活。
②Mg2+浓度过 。
③ 出现质量问题。
④变性时的温度 ,变性时间 。
结果分析
TaqDNA聚合酶
低
引物
低
短
注:DNA聚合酶需要Mg2+激活;
注:双链DNA没有解聚为单链,
导致模板DNA失效。
模板、引物、原料、酶(反应组分)失效
实验:DNA片段的扩增及电泳鉴定
2.如果不止一条条带(即出现非特异性扩增),分析其可能原因:
①模板DNA出现 。
② 特异性不强或形成 二聚体。
③Mg2+浓度过 。
④复性时的温度 等。
结果分析
污染
引物
引物
高
过低
模板、引物、原料、酶(反应组分)特异性差
注:Mg2+浓度过高(影响酶)和复性温度过低
会过度稳定非特异性结合的引物-模板复合物。
注意:
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
5.PCR扩增不能随意加大试剂用量。
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