内容正文:
第2节 基因工程的基本操作程序
第二步 基因表达载体的构建
贺老师
第3章 基因工程
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1、目的基因的筛选:
从相关的已知结构和功能清晰的基因中进行筛选
2、目的基因的获取:
人工合成、基因文库、利用PCR获取和扩增目的基因等
DNA半保留复制
原理:
PCR反应体系(条件)
过程:
3、利用PCR获取和扩增目的基因
DNA模板(目的基因)
4种脱氧核苷酸(dNTP)
引物:一小段DNA单链,与DNA母链的一段碱基序列互补配对
酶:耐高温的DNA聚合酶(Taq酶)
缓冲液、温控条件等
变性( 90℃以上,双链DNA解聚为单链)
复性( 50℃左右,引物与两条单链DNA结合)
延伸( 72℃左右,Taq酶合成新的DNA链。 )
温故知新
2
获得了足量的Bt基因后,能否直接将游离的Bt蛋白基因送入棉花细胞?
(1)游离的DNA片段进入受体细胞,一般会直接被分解;
(2)就算可以进行转录并翻译成蛋白质,游离的DNA片段也无法随着细胞分裂而进行复制,导致子代细胞中不再含有目的基因。
构建基因表达载体
(1)使目的基因在受体细胞中稳定存在,且可以遗传给下一代;
(2)使目的基因能够在受体细胞中表达和发挥作用。
1
构建基因表达载体的目的
思考:要想目的基因实现以上功能,载体需要哪些结构?
基因表达载体
抗虫基因
与载体拼接
——基因工程的核心 P80
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2
基因表达载体的组成
标记基因
复制原点
终止子
启动子
插入目的基因
复制原点:
DNA复制的起始位点
标记基因:作用为鉴别受体细胞中是否含有目的基因,从而将含有目的基因的细胞筛选出来。
启动子:
本质:有特殊序列结构的 片段
位置:基因的 。
功能: 识别和结合的部位,驱动基因转录出 。
DNA
上游
RNA聚合酶
mRNA
终止子:
本质:有特殊序列结构的 片段
位置:基因的 。
功能:终止 。
DNA
下游
转录
目的基因:能控制表达所需要的特殊性状
位置:必须插到 和 之间
启动子
终止子
抗生素抗性基因、荧光蛋白基因等。
限制酶切位点
目的基因插入位点不是随意的:基因表达载体需要启动子与终止子的调控,所以目的基因应插入启动子和终止子之间的部位,若目的基因插入启动子部位,启动子将失去原功能。
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1、基因表达载体中启动子、终止子的来源:
①如果目的基因是从自然界中已有的物种中分离出来的。
诱导型启动子:
有时为了满足需要,在载体中人工构建诱导型启动子,当 存在时,可以 或 目的基因的表达。
在构建基因表达载体时,不需要在质粒上接上特定的启动子、终止子。
——已含有启动子、终止子
②如果目的基因是通过人工方法合成的,或是cDNA。
——目的基因不含启动子和终止子
在构建基因表达载体时,需要在目的基因的前后端接上特定的启动子、终止子。
诱导物
激活
抑制
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【拓展】 启动子的类型
① 组成型启动子
这类启动子一般来自管家基因,可连续不断地启动基因的表达。
② 组织特异性启动子
其调控作用使基因往往只在某些特定器官或组织中表达,且表现出发育调节的特性。
③ 诱导型启动子
当诱导物存在时,可以激活或抑制目的基因的表达。
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启动子 终止子 起始密码子 终止密码子
本质
位置
功能
DNA片段
DNA片段
mRNA上
三个相邻的碱基
mRNA上
三个相邻的碱基
目的基因上游
目的基因下游
mRNA首端
mRNA尾端
RNA聚合酶识别和结合的部位,驱动基因转录出mRNA
终止转录
翻译的起始信号(编码氨基酸)
翻译的结束信号(不编码氨基酸)
启动子、终止子、起始密码子、终止密码子的比较
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辨析概念:
克隆载体 vs 表达载体
基因克隆载体必须具备的组分
标记基因
复制原点
启动子
终止子
限制酶切位点
基因表达载体必须具备的组分
考虑到翻译,基因表达载体插入的目的基因中必须含有能转录出完整 、
和 的序列。
mRNA的结构:
核糖体结合位点
起始密码子
终止密码子
二者在组成上有什么区别?表达载体:在克隆载体基础上增加表达元件,使外源基因在宿主细胞中转录和翻译。克隆载体:专注于DNA复制和保存,不包含表达元件(如启动子、终止子)。。 二者都有标记基因和复制原点两部分DNA片段。
表达载体在载体基础上增加了目的基因、启动子、终止子三部分结构。
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DNA分子
(含目的基因)
限制酶处理
带有黏性末端或平末端的切口
带有相同黏性末端或平末端的目的基因片段
DNA连接酶
重组DNA分子
(重组质粒)
同种
载体
(质粒)
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基因表达载体的构建过程
目的基因
限制酶
切割位点
标记基因
启动子
限制酶切割位点
终止子
复制原点
限制酶
限制酶
DNA连接酶
重组
DNA分子
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活动1. 模拟基因表达载体的构建:
(1)用图中的质粒和DNA构建基因表达载体时,不能使用SmaⅠ切割,原因是
。
SmaⅠ会①破坏质粒的抗生素抗性基因 ②破坏外源DNA中的目的基因
Hind Ⅲ
BamHⅠ
EcoRⅠ
EcoRⅠ
smaⅠ
Bt基因
方案一:
只用EcoRⅠ切割目的基因和质粒
方案二:
同时用BamHⅠ和HindⅢ (或EcoRⅠ和HindⅢ)切割目的基因和质粒
图甲、乙表示质粒及目的基因所在DNA片段,图中箭头表示相关限制酶的酶切位点。
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使用一种限制酶(EcoR Ⅰ)进行切割Bt基因和pBI121质粒,共有几种连接情况?请大家尝试剪切、拼接操作。
载体与目的基因反向连接
载体与目的基
因正向连接
目的基因与目的基因之间的连接
目的基因自身环化
载体
自身环化
载体与载体之间的连接
方案一:单酶切法
转录方向错误影响:若目的基因包含启动子或依赖载体上的启动子,反向插入会导致转录方向与预期相反,无法生成功能性mRNA。
案例:假设目的基因编码绿色荧光蛋白(GFP),反向插入后,即使转录生成mRNA,其序列也会与正向插入的mRNA互补,无法翻译为GFP蛋白。若载体上的启动子为RNA聚合酶II依赖型,反向插入可能导致转录提前终止或生成无意义的转录本。
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载体
自身环化
片段间
的连接
目的基因自身环化
质粒自身环化
目的基因与质粒连接
目的基因与目的基因连接
质粒与质粒连接
正向连接 反向连接
目的基因
1
1’
2
2’
1
2
2’
1’
2
2’
1’
1
①质粒、目的基因自身环化;
②质粒与目的基因随意连接
单酶切法缺点:
总结:如果用同一种限制酶分别切割目的基因和质粒,再用DNA连接酶处理后会出现几种产物?(只考虑两两结合)
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如何防止目的基因和质粒自身环化以及目的基因反向连接?
a
b
a
b
双酶切的优点:
防止质粒、目的基因自身环化
防止质粒与目的基因随意连接
选择两种不同的限制酶同时对目的基因和质粒切割,使基因两端产生两个不同的粘性末端
方案二:双酶切法
a酶:
b酶:
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思考:若目的基因两端无合适的限制酶切割位点怎么办?
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3'
3'
5'
5'
3'
3'
5'
5'
3'
5'
3'
5'
5'
3'
3'
3'
3'
引物1
引物2
引入限制酶识别序列
引入限制酶识别序列
5'
3'
3'
5'
3'
3'
5'
3'
3'
3'
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3'
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3'
使用引物设计引入酶切位点,通过PCR扩增实现突变。
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活动1. 模拟基因表达载体的构建
方案一:HindⅢ
方案二:EcoRⅠ、HindⅢ
方案三:XbaⅠ、BamHⅠ
方案四:HindⅢ、BamHⅠ
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a
b
c
d
限制酶切割
DNA连接酶连接
缺点1
缺点2
缺点3
思考:如何确定以上缺点?
单酶切的缺点
反向连接重组DNA
质粒重新环化
目的基因被环化
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$$