内容正文:
PCR技术中的引物
生物二轮复习微专题
PCR实验原理介绍
近年部分高考试题中相关内容考察
卷序 试题 试题分析 考察引物 课标要求
2023年浙江卷 考察基因编辑技术,属于情境题 √ 1、阐明基因工程的基本操作程序主要包括目的基因的获取、基因表达载体的构建、目的基因导入受体细胞和目的基因及表达产物的检测鉴定等步骤
2、教学提示:利用聚合酶链式反应(PCR)扩增DNA片段并完成电泳鉴定,或运用软件进行虚拟PCR实验
2023年山东卷
考察PCR技术,属于情景题 √
2023年湖北卷
考察PCR技术,属于理解题
2022年湖北卷 考察PCR技术,属于材料分析题
2022年福建卷
考察基因工程,属于理解题 √
2021年全国卷
考察PCR技术,属于识记题
√
2021年湖北卷
考察PCR技术,属于情境题 √
考察PCR技术,属于材料分析题
2020年北京卷
√
考察PCR技术的应用,属于情境题
2020年江苏卷
。。。。。。 。。。。。。
PCR中的引物:
别怕!
我们一起来解决!!
课标有要求,
教材呈现有限,
高考考察难度大,
教
材
中
的
引
物
1、引物是:
2、引物的作用:
一小段能与DNA母链的一段碱基序列互补配对的短单链核酸
使Taq酶能够从其3’端开始连接脱氧核苷酸
一、引物的作用
例题1(2011年江苏卷)请回答基因工程方面的有关问题;PCR反应体系中含有热稳定DNA聚合酶,下面的表达式不能正确反映DNA聚合酶的功能,这是因为___ _______ ______ ______ ______ ______ ______ ______ ______ ______ ______ ______ ____________ ______ _______
DNA聚合酶不能从头开始合成DNA,而只能将单个脱氧核苷酸连续结合至双链 DNA 片段的引物链上。
二、引物的设计
例题2 (2021 .湖北)某实验利用PCR技术获取目的基因,实验结果显示,除了目的基因条带(引物与模板完全配对)外,还有2条非特异条带(引物和模板不完全配对)。为了减少反应中非特异条带的产生,以下措施中有效的是
A.增加模板DNA的量
B. 延长热变性的时间
C.延长延伸的时间
D.提高复性的温度
答案:D
1、一般而言,引物越长 ,G+C比例越高,退火温度越高,扩增特异性强。
二、引物的设计
例题3(2011年江苏卷)请回答基因工程方面的有关问题∶设计引物是PCR技术关键步骤之一。某同学设计的2组引物如图,
都不合理,请分别说明理由。
①第1组:_____________ _;
②第2组:________ _____________。
引物1和引物11局部发生碱基互补配对而失效
引物1自身折叠后会出现局部碱基互补配对而失效
答案∶(1)引物是根据目的基因的一段已知核苷酸序列设计合成的(或引物能与目的基因通过碱基互补配对结合);
(2)第1组∶引物Ⅰ和引物Ⅱ局部发生碱基互补配对而失效;第2组∶引物Ⅰ'自身折叠后会出现局部碱基互补配对而失效;
(3)①③。
× ×
2、引物自身 不应存在互补配对 序列(发夹结构);
两条引物之间 不应存在互补配对 序列。
二、引物的设计
例题4(2019·江苏)(节选)图1是某基因工程中构建重组质粒的过程示意图,载体质粒P0具有四环素抗性基因(tetr)和氨苄青霉素抗性基因(ampr)。请回答下列问题:
(4)为鉴定筛选出的菌落中是否含有正确插入目的基因的重组质粒,拟设计引物进行PCR鉴定。图2所示为甲、乙、丙3条引物在正确重组质粒中的相应位置,PCR鉴定时应选择的一对引物是 。某学生尝试用图中另外一对引物从某一菌落的质粒中扩增出了400bp片段,原因是
乙、丙
选择了引物甲和乙并且目的基因反向连接
三、引物的应用
1、通过选择合适的引物,确定目的基因的正确插入方向
原理是:
用限制酶剪切该DNA,随后使用DNA连接酶将获得的酶切产物环化,这样就获得了已知序列两侧携带有未知序列的环状DNA分子。
以该已知序列为模板设计一对相反方向的特异性引物,该引物对已知序列反向,
但对未知序列却是相向的,
从而得以扩增出未知序列。
反向PCR
如何扩增已知序列两端的未知序列呢?
②④
DNA序列(虚线处省略了部分核苷酸序列)
已知
序列
PCR
引物 ①5′—AACTATGCGCTCATGA—3′
②5′—GCAATGCGTAGCCTCT—3′
③5′—AGAGGCTACGCATTGC—3′
④5′—TCATGAGCGCATAGTT—3′
例题5 (2022·江苏卷)(节选)如果已知一小段DNA的序列,可采用PCR的方法,简捷地分析出已知序列两侧的序列,具体流程如图所示(以EcoR Ⅰ酶切为例)。请据图回答问题:
(3)若下表所列为已知的DNA序列和设计的一些PCR引物,步骤Ⅲ选用的PCR引物必须是________(从引物①②③④中选择,填编号)。
三、引物的应用
2、巧妙设计引物,通过反向PCR,实现对已知序列两侧的未知序列的扩增。
例题6、常见的病毒疫苗有灭活疫苗、蛋白疫苗和重组疫苗等。已知某甲流病毒的特异性蛋白N(具有抗原性)的cDNA编码序列(目的基因)如下图。为了制备稳定性更好的N蛋白疫苗,可以通过对目的基因加以改造,使PCR扩增出的编码序列在图中标记处的GTG改为ATG,再通过基因工程技术获得大量稳定蛋白N。
请设计引物1、引物2的碱基序列。
3' ATCGCCTAGAACGCTT 5'
5' TGGATACGTAGTACAT 3'
引物中改变个别碱基,不影响引物与模板链的结合,实现定点诱变
1.若要将基因内部的G/C碱基对替换成A/T碱基对,引物又该设计几种呢?如何设计?
引物1
引物2
引物3
引物4
5' TGGACACGTAGTACAT 3'
5' ACATCGACACACAATC 3'
5' TTCGCAAGATCCGCTA 3'
5' GATTGTGTGTCGATGT 3'
引物1
5’ TGGACACGTAGTACAT......ACATCGACACGCAATC......TAGCGGATCTTGCGAA 3’
3’ ACCTGTGCATCATGTA.......TGTAGCTGTGCGTTAG.......ATCGCCTAGAACGCTT 5’
引物2
2.进行PCR时是4种引物一起加入,还是两两分组加入?如何设计?
引物3
引物4
3.请通过图示展示该PCR的全过程
G
C
引3
T
引2
G
G
引3
T
引3
T
引2
A
√
√
引3
T
引2
A
G
C
引1
C
引4
A
√
引4
A
C
引1
T
引4
A
√
引4
A
引1
T
混合
引2
A
引1
T
引3
T
引4
A
引2
A
引1
T
重叠延伸PCR技术
例题7 重叠延伸PCR技术利用在需要诱变的位置合成两个带有变异基因碱基的互补引物,然后分别与引物a和引物d做PCR,这样得到的两个PCR引物产物都带有变异基因,并且彼此重叠,再将重叠部位进行重组PCR就能得到诱变PCR产物如图1.请据图回答:
①图1,PCR扩增DNA的过程中,引物a、b、c、d中,PCR1应选择图1中引物_____,大量扩增突变产物AD则应选择引物_____。
②重叠延伸PCR通过_______________________实现定点突变。PCR1和PCR2需要分别进行的原因是__ ___。
引物b和引物c可以互补配对,导致引物失效
在引物b和c上引入突变
a和d
a和b
三、引物的应用
3、通过设计引物,实现扩增对象末端的定点突变;
4、结合重叠延伸PCR技术,可实现基因内部的突变。
一、引物的作用:
1、引物是一小段能与DNA母链的一段碱基序列互补配对的短单链核酸;
2、引物的作用是使Taq酶能够从其3’端开始连接脱氧核苷酸。
二、引物的设计:
1、相对而言,一般引物越长 ,G+C比例越高,退火温度越高,扩增特异性强;
2、引物自身不应存在互补配对序列(发夹结构);两条引物之间不应存在互补配对序列。
三、引物的应用:
1、通过选择合适的引物,确定目的基因的正确插入反向 ;
2、巧妙设计引物,通过反向PCR,实现对已知序列两侧的未知序列的扩增。
3、通过设计引物,实现扩增对象末端的定点突变;
4、结合重叠延伸PCR技术,可实现基因内部的突变。
PCR中的引物课堂小结:
引物相关的考察还有很多,如:
1、引物的计算
2、引物5’端限制酶识别位点的修饰
3、实时荧光定量RT-PCR用于RNA病毒的核酸检测
。。。。。。
PCR中的引物课堂小结:
1、目的基因测序(登录GENEBANK相关网站查找)
2、根据目的基因的序列(上下游)设计引物:手动或者借助引物设计软件
3、写出引物序列后,发给引物生产公司生产
实践中引物这样来
希望最优秀的你将来能从事生物科学基因工程相关的研究,
让我们今天的异想天开在明天成为现实,报效祖国,造福全人类!
1、(2021·天津)(节选)乳酸菌是乳酸的传统生产菌,但耐酸能力较差,影响产量。酿酒酵母耐酸能力较强,但不产生乳酸。研究者将乳酸菌的乳酸脱氢酶基因(LDH)导入酿酒酵母,获得能产生乳酸的工程菌株。图为构建表达载体时所需的关键条件。
获得转基因酿酒酵母菌株的过程如下:设计引物扩增乳酸
脱氢酶编码序列。为使扩增出的序列中编码起始密码子的序
列由原核生物偏好的 GTG 转变为真核生物偏好的 ATG,且
能通过双酶切以正确方向插入质粒,需设计引物 1 和2。其中
引物1的5‘端序列应考虑: 和 , ,
答案:包含 BamHI 的识别序列 将 GTG 改为ATG
补充训练
2、(2023·山东)(节选)科研人员构建了可表达J-V5融合蛋白的重组质粒并进行了检测,该质粒的部分结构如图甲所示,其中V5编码序列表达标签短肽V5。
(2)构建重组质粒后,为了确定J基因连接到质粒中且插入方向正确,需进行PCR检测,若仅用一对引物,应选择图甲中的引物 。
答案:(2) F2和R1或F1与R2
补充训练
3、(2021山东)人类γ基因启动子上游的调控序列中含有BCL11A蛋白结合位点,该位点结合BCL11A蛋白后,γ基因的表达被抑制。通过改变该结合位点的序列,解除对γ基因表达的抑制,可对某种地中海贫血症进行基因治疗。科研人员扩增了γ基因上游不同长度的片段,将这些片段分别插入表达载体中进行转化和荧光检测,以确定BCL11A蛋白结合位点的具体位置。相关信息如图所示。回答下列问题:
(1)为将扩增后的产物定向插入载体指导荧光蛋白基因表达,
需在引物末端添加限制酶识别序列。据图可知,在F1~F7末端
添加的序列所对应的限制酶是 ,在R末端
添加的序列所对应的限制酶是 。本实验中,从产物扩增到载体构建完成的整个过程共需要
种酶。(2)将构建的载体导入除去BCL11A基因的受体细胞,成功转化后,含F1~F6与R扩增产物的载体表达荧光蛋白,受体细胞有荧光,含F7与R扩增产物的受体细胞无荧光。含F7与R扩增产物的受体细胞无荧光的原因是 。(3)向培养液中添加适量的雌激素,含F1~F4与R扩增产物的受体细胞不再有荧光,而含F5~F6与R扩增产物的受体细胞仍有荧光。若γ基因上游调控序列上与引物序列所对应的位置不含有BCL11A蛋白的结合位点序列,据此结果可推测,BCL1IA蛋白结合位点位于
补充训练
Sal I
EcoRI
6
F7与R扩增产物不含完整的启动子,荧光蛋白基因不表达
引物F4与F5在调控序列上所对应序列之间的区段上
$$