内容正文:
微课1:与蛋白质的合成与水解的相关计算
1、 蛋白质的相对分子质量、氨基酸数、肽链数、肽键数和失去水分子数的关系
可将肽链看作 “C”与“—CO—NH—”交替连接构成的基本骨架,在“C”上连接着—R和—H,在肽链的两端分别是游离的“—NH2”“—COOH”,如下图:
(1)肽键数=失去水分子数=氨基酸数-肽链数
(2)蛋白质的相对分子质量=氨基酸数×氨基酸的平均相对分子质量-脱去水分子数×18。若有p个二硫键生成(—S—S—,由2个—SH脱去2个H形成),则还应减去2p
肽链数目
氨基酸数
肽键数目
脱去水分子数
游离氨基数目
游离羧基数目
多肽(蛋白质)的相对分子质量
1条
n
n-1
n-1
至少1个
至少1个
an-18×(n-1)
m条
n
n-m
n-m
至少m个
至少m个
an-18×(n-m)
注:设氨基酸的平均相对分子质量为a,生成链状多肽。
二、蛋白质中游离氨基或羧基的计算
(1)至少含有的游离氨基或羧基数=肽链数。
(2)游离氨基或羧基数=肽链数+R基中含有的氨基或羧基数。
例题1.绿色荧光蛋白简称GFP,最初是从维多利亚多管发光水母中分离出来的结构蛋白,其相关数据如图所示,下列有关叙述正确的是( )
A.该分子彻底水解将产生126种氨基酸
B.假定每个氨基酸平均相对分子质量为a,则这个蛋白质分子的相对分子质量表达式是126a﹣2250
C.该化合物水解时,一共需要124个水分子
D.该肽链水解时,水中氢的去向是形成氨基
【答案】C
【解析】分析柱形图:该蛋白质中,游离羧基的总数和游离氨基的总数都是17,R基中的羧基数目是15,说明该蛋白质是由两条肽链组成的。A、构成蛋白质的氨基酸种类约为21种,因此该分子彻底水解最多能产生21种氨基酸,A错误;根据分析可知,该蛋白质含有两条肽链,因此形成该肽链时脱掉124分子水,假定每个氨基酸平均相对分子质量为a,则这个蛋白质分子的相对分子质量表达式是126a﹣18×124=126a-2232,B错误;该化合物含有124个肽键,因此该化合物水解时,一共需要124个水分子,C正确;该肽链水解时,水中氢的去向是形成氨基和羧基,D错误。
三、氨基酸的排列和多肽种类的计算
多肽的不同取决于氨基酸的数目、种类和排列顺序。
(1)假如有足量的n种氨基酸形成一个m肽,则形成链状多肽的种类有nm种
(2)假如有n种氨基酸形成一个n肽,且每种氨基酸只有一个,则形成的链状n肽的种类有n(n-1)(n-2)…1=n!
例题2. 现有足量的甘氨酸、丙氨酸、谷氨酸3种氨基酸,它们能形成的三肽种类以及包含3种氨基酸的三肽种类分别最多有( )
A.9种,9种 B.6种,3种 C.18种,6种 D.27种,6种
【答案】D
【解析】足量的3种氨基酸构成的三肽有33=27种。对于包含3种氨基酸的三肽种类的理解,可借用示意图“□—□—□”来分析,即第一个位置的氨基酸有3种情况,第二个位置只能从另2种氨基酸中任选1种,第三个位置只能安放剩余的一种,即321=6种。
四、环状肽中氨基酸数、肽链数、肽键数、失去水分子数和相对分子质量
肽键数=失去水分子数=氨基酸数,游离氨基数和游离羧基数最少为零。
例题3.鬼笔环肽是一种从死亡帽蘑菇中分离岀来的剧毒多肽物质,为环状七肽。根据编码该物质的基因可知细胞内先合成一个链状含34个氨基酸的前肽,翻译后经相关酶水解、环化等,才能形成鬼笔环肽。下列相关叙述正确的是( )
A.翻译形成前肽时需脱掉33分子水,只含一个游离的氨基和羧基
B.前肽水解后脱掉27个氨基酸,剩下的氨基酸形成六个肽键
C.该环肽中氮原子的数目与构成该环肽的氨基酸种类有关
D.环化形成环肽以后,不再具有游离的氨基和羧基
【答案】C
【解析】前肽是含有34个氨基酸的一条多肽链,合成时是形成33个肽键,脱掉33个水分子,至少含有一个游离的氨基和羧基,A错误;前肽含有34个氨基酸,鬼笔环肽有7个氨基酸,前肽需要脱掉27个氨基酸,才能变为鬼笔环肽,环状七肽具有7个肽键,B错误;环肽中氮原子还可存在于R基中,氮原子的数量与氨基酸的种类有关,C正确;环化形成环肽后,R基中仍可能具有游离的羧基和氨基,D错误。
五、利用原子守恒法进行蛋白质的计算
氨基酸的结构通式是解答此类题目的突破口。在一个氨基酸中,若不考虑R基,至少含有2个碳原子、2个氧原子、4个氢原子和1个氮原子。在脱水缩合形成多肽时,要失去部分氢、氧原子,但是碳原子、氮原子的数目不会减少。其相关数量关系如下:
(1)碳原子数=氨基酸的分子数×2+R基上的碳原子数。
(2)氢原子数=各氨基酸中氢原子的总数-脱去的水分子数×2。
(3)氧原子数=各氨基酸中氧原子的总数-脱去的水分子数=肽