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蛋白质计算问题中的两种非肽键结构
一个氨基酸分子的羧基()和另一个氨基酸分子的氨基(-NH2)相连接,同时失去一分子水,这种结合方式叫做脱水缩合。连接两个氨基酸分子的那个键()叫做肽键。如下图所示:
其中虚线框中 为肽键结构,肽键是蛋白质结构中的重要组成,而且肽键的数目与氨基酸数目和脱去水分子数目密切相关,所以在蛋白质计算问题中识别肽键结构,弄清肽键数目,是解决问题的关键所在。而在蛋白质计算问题中就有以下两种非肽键结构极易同肽键相混淆,需要注意区分。
1. —CO—NH2—不一定是肽键
肽键是连接两个氨基酸分子的那个键(),它的前提是连接两个氨基酸分子。判断是否为肽键,首先应将水解,观察是否可以重新形成两个氨基酸分子。需要满足判断氨基酸分子的标准:每中氨基酸分子至少都含有一个羧基()和一个氨基(-NH2),并且一个羧基和一个氨基连接在同一个碳原子上。若水解后形成的两侧化合物满足以上判断氨基酸分子的标准,即水解后形成两个氨基酸分子,则是肽键;相反,若水解后形成的两侧化合物不满足以上判断氨基酸分子的标准,即水解后不能形成两个氨基酸分子,则不是肽键。的水解反应方程式如下:
例题:根据下图所示的化合物结构简式,回答下列问题:
(1)该化合物的名称是 ,含有 个肽键。
(2)写出构成该化合物的R基分别为 。
(3)该化合物尽进行水解,需要 水分子。
分析:该化合物的结构式中有,可能是肽键。依据肽键的判断方法,需要将该化合物进行水解:
观察水解形成的3个化合物a、b、c,由氨基酸的判断标准可知a、b是氨基酸,而c不是氨基酸,所以连接b、c的B化学键不是肽键。该化合物只有A处一个肽键,为二肽,其水解反应方程式为:
该化合物只有肽键A水解形成a、d两个氨基酸,e、f分别为a、d两个氨基酸的R基,也是该化合物的R基。
答案:(1)二肽 1
(2)
(3)1
2.连接肽链之间的化学键不是肽键
一个蛋白质分子可以含有一条或多条肽链,肽链也可以通过一定的化学键互相连接在一起。这些肽链不成直线也不在同一个平面上,而是形成非常复杂的空间结构,决定了蛋白质分子结构的多样性。肽键存在于同一条肽链想相邻两个氨基酸分子之间。连接同一肽链的不相邻两个氨基酸分子之间的化学键不是肽键,连接不同肽链之