内容正文:
3.2.2 DNA片段的扩增及电泳鉴定
DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.DNA体外扩增的原理
PCR利用了DNA热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合。
PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器,一次PCR一般要经历30次循环。
2.DNA片段电泳鉴定的原理
DNA分子具有可解离的基团,在一定的PH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳。
在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象等有关。
凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下被检测出来。
(1)仪器
(2)材料
PCR 仪、微量离心管、微量移液器、一次性吸液枪头、电泳装置(包括电泳仪电泳槽等)
4种脱氧核苷酸的等量混合液、2种引物、DNA 聚合酶、模板 DNA 、扩增缓冲液、无菌水、电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖和核酸染料等
PCR仪
微量离心管
微量移液器
电泳装置
3、材料用具
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
3、材料用具
PCR反应体系的配方
10倍浓缩的扩增缓冲液 5ul
20mmol/l 的4种脱氧核苷酸的等量混合液 1ul
20umol/l 的引物I 2.5ul
20umol/l 的引物II 2.5ul
H2O 28-33ul
1-5U/ul 的Taq DNA聚合酶 1-2U
模板DNA 5-10ul
总体积 50ul
注:模板DNA的用量为1pg-1ug
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
4、实验步骤(PCR)
用微量移液器按照PCR反应体系配方或PCR试剂盒的说明书,在微量移液管中依次加入各组分。
待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子。将微量离心管放入离心机里,离心约10s,使反应液集中在离心管的底部。
参照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
移液
离心
扩增
提高反应速率
预变性的目的:
使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
4、实验步骤(电泳鉴定)
根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%-1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
配制琼脂糖溶液
制备凝胶
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物(Marker)。
加样
电泳、观察
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳。取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
4、实验步骤(电泳鉴定)
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
注意:
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
5.PCR扩增不能随意加大试剂用量。
【探究·实践】DNA片段的扩增及电泳鉴定
11
探讨点1.未出现扩增条带的主要原因有哪些?
探讨点2.出现非特异性扩增条带的主要原因有哪些?
探讨点3. 你是否成功扩增出DNA片段?判断的依据是什么?
探讨点4.你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。
(1)TaqDNA聚合酶失活或浓度过低。 (2)引物出现质量问题。
(3)Mg2+浓度过低。 (4)变性时的温度低,变性时间短。
(1)模板DNA出现污染。
(2)引物特异性不强、引物设计不合理、引物过短。
(3)Mg2+浓度过高。 (4)复性时的温度过低等。
可以在紫外灯下直接观察到DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。
如果扩增不成功,可能的原因有:漏加了PCR的反应成分,各反应成分的用量不当,PCR程序设置不当等。如果扩增结果不止一条条带,可能的原因有:引物设计不合理,它们与非目的序列有同源性或容易形成二聚体;退火温度过低;DNA聚合酶的质量不好等。
(1)利用PCR扩增DNA片段时,在第一轮循环的变性之前,通常要用94 ℃的高温处理反应液5 min进行预变性。( )
(2)PCR中离心的目的是让反应组分在离心管中分层分布。( )
解析:PCR中离心的目的是让反应组分集中分布在离心管的底部。
(3)电泳鉴定PCR产物时,应在每个加样孔中加入等量的PCR产物与凝胶载样缓冲液的混合液。( )
解析:电泳鉴定PCR产物时,应在一个加样孔中加入指示分子大小的标准参照物,其他加样孔中加入等量的PCR产物与凝胶载样缓冲液的混合液。
√
×
×
【基础过关】
【典例】下列关于PCR的说法,错误的是( )
A.PCR是体外复制DNA的技术
B.PCR过程中只需要一个模板DNA、两种引物分子、大量脱氧核苷酸原料
C.TaqDNA聚合酶要具有耐高温的特点
D.PCR利用了DNA的热变性原理
解析:PCR是体外复制DNA的技术,A正确;PCR过程中需要一种模板DNA、两种引物分子、大量脱氧核苷酸原料,还需要扩增缓冲液、TaqDNA聚合酶等,B错误;TaqDNA聚合酶具有耐高温的特点,C正确;PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合,D正确。
B
【变式训练】用PCR方法检测转基因植株是否成功导入目的基因时,得到以下电泳图谱,其中1号为DNA标准样液(Marker),10号为蒸馏水。PCR时加入的模板DNA如图所示。据此做出分析不合理的是( )
A.PCR产物的分子大小在250至500 bp之间
B.3号样品为不含目的基因的载体DNA
C.9号样品对应植株不是所需的转基因植株
D.10号的电泳结果能确定反应体系等对实验结果没有干扰
B
4-9号是转基因植株的DNA,理论上应包含目的基因。
解析 PCR过程中,可以通过设计特定的引物来扩增特定的DNA片段。4~9号是转基因植株,理论上应包含目的基因,结合2号野生型和10号蒸馏水组的结果,推测包含目的基因的片段大小应为250~500 bp,A正确;3号PCR结果包含250~500 bp片段,应包含目的基因,B错误;9号PCR结果不包含250~500 bp片段,所以不是所需转基因植株,C正确;10号放入蒸馏水,可排除反应体系等对结果的干扰,由图可知,10号的电泳结果能确定反应体系等对实验结果没有干扰,D正确。
14
Multimedia Cloud Transcode (cloud.baidu.com)
$