内容正文:
第2节
第4章 基因工程
基因工程的基本操作程序
苏云金杆菌
普通棉花(无抗虫特性)
抗虫基因
转入植物细胞
提取
2.基因表达载体 的构建(核心)
1.目的基因的 筛选与获取
3.将目的基因 导入受体细胞
4.目的基因的 检测与鉴定
Bt基因
Ti质粒
重组DNA分子
将目的基因插入染色体DNA中
结合转基因抗虫棉案例回答以下问题:
(1)转基因抗虫棉的目的基因是:
(2)转基因抗虫棉的受体细胞是:
抗虫基因—苏云金杆菌的Bt 基因
棉花植株细胞
目的基因:用于改变受体细胞性状或获得预期表达产物等的基因。(P76第2段)
主要指的是编码蛋白质的基因。
第一步:目的基因的筛选与获取
1、目的基因的筛选:
思考1:
自然界中抗虫基因种类多如:Bt基因、蛋白酶抑制基因、凝集素基因等,如何选择合适的基因?
(1)从相关的已知结构和功能清晰的基因中进行筛选
掌握了Bt基因的序列信息
用苏云金杆菌制成的生物杀虫剂,广泛用于防治棉花虫害已有多年历史。
Bt基因的表达产物--Bt抗虫蛋白破坏鳞翅目昆虫的消化系统。
苏云金杆菌的杀虫作用与Bt基因有关
Bt基因是培育转基因抗虫棉较为合适的目的基因
第一步:目的基因的筛选与获取
DNA测序仪
明确了目的基因后,该怎么获得它?
序列数据库
(如GenBank)
核苷酸序列比对
氨基酸序列比对
序列比对工具(如BLAST)
(2)认识基因结构和功能的技术方法:
1、目的基因的筛选:
第一步:目的基因的筛选与获取
测序技术
2、目的基因的获取:
(1)人工合成:
前提:
方法:
基因比较小、核苷酸序列已知
通过DNA合成仪用化学方法直接合成
DNA合成仪
第一步:目的基因的筛选与获取
(2)从基因文库中获取目的基因
将某种生物的基因片段,导入到受体菌中,各受体菌分别含不同基因,这些受体菌称为基因文库。
种类
部分基因文库:只包含了一种生物的部分基因,
如:cDNA文库
基因组文库: 含有一种生物的全部基因
缺点:工作量大,盲目性强
基因组文库
cDNA文库
没有启动子、终止子和内含子等非编码序列
PCR——聚合酶链式反应
(3)利用PCR获取和扩增目的基因
PCR由穆里斯等人于1985年发明,为此,穆里斯于1993年获得诺贝尔化学奖。
根据DNA半保留复制的原理,在体外提供参与DNA复制的各种组分与反应条件,对目的基因的核苷酸序列进行大量复制的技术。
第一步:目的基因的筛选与获取
耐高温的
缓冲溶液
(含Mg2+)
激活真核细胞和细菌的DNA聚合酶
(体内)DNA复制的条件
模板
原料
酶
能量
DNA解旋后的两条单链
游离的4种脱氧核苷酸
解旋酶、DNA聚合酶等
主要由ATP提供
第一步:目的基因的筛选与获取
A T C G A A T C G G T T
T A C C T T A G C C A A
DNA
聚合酶
引物
3′
3′
5′
5′
2.DNA复制过程需要引物的原因:
引物:一小段能与DNA母链的一段碱基序列互补配对的短单链核酸。(长度通常为20-30个核苷酸)。
母链DNA
子链DNA
·细胞内通常以RNA单链为引物
·细胞外(PCR)一般以DNA单链为引物
DNA聚合酶不能从头合成子链
DNA复制时,子链延伸的方向是从5’→3’端。
P77“相关信息栏”
(3)利用PCR获取和扩增目的基因
利用PCR获取和扩增目的基因——PCR过程(书p78-79)
待扩增的DNA片段
引物
耐高温的DNA聚合酶
4种脱氧核苷酸
变性
温度上升到90℃以上,双链DNA解旋为单链
复性
当温度下降到50℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
延伸
当温度上升到72℃左右时,溶液中的4种脱氧核苷酸在耐高温的DNA聚合酶的作用下,根据碱基互补配对原则合成新的DNA链。
缓冲溶液
(含Mg2+)
利用PCR获取和扩增目的基因——PCR过程(书p78-79)
循环N次:2n个DNA分子
当DNA中GC含量高时,变性温度需适当提高
破坏氢键
引物结合在DNA模板链的3'端
复性温度与引物长度和引物GC比例呈正相关
引物是子链的一部分
利用PCR获取和扩增目的基因
DNA体外扩增的原理p84
①PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合。
②PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器,一次PCR一般要经历30次循环。
1、PCR技术获取目的基因时要经过几次循环才能从DNA分子中分离出目的基因?
至少3次
第一次
第二次
5'
3'
5'
3'
3'
5'
思考讨论
第三次
1、两个引物要分别与目的基因两条链的3’端互补配对
引物设计的原则:
2、引物自身、不同引物之间尽量不要互补配对
3、引物长度通常为20-30个核苷酸,太短特异性差,太长扩增效率低
利用PCR获取和扩增目的基因——PCR过程(书p78-79)
4、引物的5’端有时要加上酶切位点
探究·实践
DNA片段的扩增及电泳鉴定
PCR 的产物一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定。
DNA片段电泳鉴定的原理
①DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷,在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳;
②在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象等有关
③凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下被检测出来。
利用PCR获取和扩增目的基因——PCR产物鉴定
琼脂糖凝胶电泳(书p84)
探究·实践
六、DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
5.PCR扩增不能随意加大试剂用量。
注意
利用PCR获取和扩增目的基因——PCR产物鉴定
琼脂糖凝胶电泳(书p74)
利用PCR获取和扩增目的基因——提取DNA模板
DNA的粗提取与鉴定(书p74)
1.实验思路:
DNA、RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质方面存在差异,可以利用这些差异,选用适当的物理或化学方法对它们进行提取。
2.实验原理:
DNA不溶于酒精,但某些蛋白质溶于酒精
DNA能溶于物质的量浓度为2mol/L的NaCl溶液
在一定温度下(沸水浴),DNA被二苯胺试剂染成蓝色
初步分离DNA和蛋白质
溶解DNA
鉴定DNA
现配现用
利用PCR获取和扩增目的基因——提取DNA模板
DNA的粗提取与鉴定(书p74)
利用PCR获取和扩增目的基因——提取DNA模板
DNA的粗提取与鉴定(书p74)
选DNA含量相对较高的组织:
·不选哺乳动物成熟红细胞(无细胞核)
·能选鸡血(要加柠檬酸,防止血液凝固)
·取动物细胞做材料时,可加蒸馏水使细胞吸水涨破
利用PCR获取和扩增目的基因——提取DNA模板
DNA的粗提取与鉴定(书p74)
裂解细胞,释放DNA
不能用滤纸,滤纸会吸附DNA
①抑制微生物的核酸水解酶活性,防止DNA降解
②低温能增加DNA的柔韧性,减少断裂
避免破坏DNA
第一步:目的基因的筛选与获取
原理:
反应体系(条件)
过程:
1、筛选:
从相关的已知结构和功能清晰的基因中进行筛选
2、获取:
人工合成、从基因文库中获取、利用PCR获取和扩增目的基因
利用PCR获取和扩增目的基因
DNA半保留复制
DNA模板(目的基因)
4种脱氧核苷酸
引物
耐高温的DNA聚合酶
Mg2+
高温条件等
变性、复性、延伸
提取DNA并鉴定(p74)
琼脂糖凝胶电泳(p84)
(一)目的:
①让基因在受体细胞中稳定存在,并且遗传给下一代;
(二)组成:
②使目的基因能够表达和发挥作用
目的基因该插入什么位置?
第二步:基因表达载体的构建
基因工程的核心
是一段有特殊序列结构的DNA片段,位于基因的前端,RNA聚合酶识别和结合的部位;驱动基因转录出mRNA
是一段有特殊序列结构的DNA片段,位于基因的下游,使转录在所需要的地方停下来
重组DNA分子
DNA
连接酶
目的基因
限制酶切割位点
获取目的基因
限制酶
(1)用一定的限制酶切割质粒,使
其出现一个切口,露出黏性末端。
(2)然后用同种限制酶或能产生相同末端的限制酶切割含有目的基因的DNA片段。
启动子
限制酶切割位点
终止子
标记基因
复制原点
质粒
限制酶
(3)再利用DNA连接酶将含目的基因的DNA片段拼接到载体的切口处,形成了一个重组DNA分子(重组质粒)
基因表达载体构建模式图
第二步:基因表达载体的构建
基因工程的核心
目的基因
第二步:基因表达载体的构建
基因工程的核心
问题1: 使用一种限制酶进行切割,会得到几种重组DNA?有何缺点?怎么改进?
自连
片段间的连接
目的基因自身环化
质粒自身环化
目的基因与质粒连接(正连、反连)
目的基因与目的基因连接
质粒与质粒连接
①单酶切法得到的重组DNA结果
目的基因
第二步:基因表达载体的构建
基因工程的核心
问题2:如何防止目的基因和质粒的自身环化以及目的基因的反向连接?
选择两种不同的限制酶同时对目的基因和质粒切割
a
b
a
b
②双酶切法
目的基因与质粒连接(正连)
图甲是含有目的基因的外源DNA片段,图乙是用于将目的基因导入受体细胞的质粒(阴影部分表示抗生素抗性基因),相关限制酶的作用部位如图所示,现欲培养转基因抗病植株,回答下列问题。
上述操作中不宜选用Sma I,原因是Sma I会破坏__________和_____________。
目的基因
抗性基因
限制酶的选择原则:
(1)不破坏目的基因、复制原点、启动子、终止子和标记基因
(2)构建表达质粒时,要选择启动子和终止子之间的酶切位点
(3)确保质粒和目的基因出现相同黏性末端(即目的基因用什么酶去切,质粒也要用同种酶或同尾酶去切)
(4)最好采用双酶切法(保证质粒/目的基因两端是不同的末端,防止它们的自身环化,防止目的基因反接等)
第二步:基因表达载体的构建
基因工程的核心
1、构建基因表达载体时为了防止目的基因和质粒的自身环化,可以选用BamHⅠ和HindⅢ剪切
2、表达载体构建时需要用到限制酶SmaⅠ
第二步:基因表达载体的构建
第三步:将目的基因导入受体细胞——植物细胞
(1)花粉管通道法 (我国独创)
①用微量注射器将含目的基因的DNA溶液直接注入子房中;
②在植物授粉后一定时间内,剪去柱头,将DNA溶液滴在花柱切面,使目的基因通过花粉管通道进入胚囊。
子房
花粉
柱头
花粉管
精子
卵细胞
胚囊
适用植物:开花植物
第三步:将目的基因导入受体细——植物细胞
农杆菌是一种在土壤中生活的微生物,它能在自然条件下侵染双子叶植物和裸子植物。
(2)农杆菌转化法
转化:目的基因进入受体细胞内,并且在受体细胞内维持稳定和表达的过程。
此处“转化”与肺炎链球菌转化实验中的“转化”含义相同,实质都是基因重组。
第三步:将目的基因导入受体细——植物细胞
构建表 达载体
含目的基因的重组Ti质粒
表现出新性状的植株
导入植物
细胞
植物细胞
将目的基因插入染色体DNA中
目的基因
Ti质粒
T-DNA
含重组Ti质粒的农杆菌
转入农杆菌
过程:
农杆菌转化法示意图
(2)农杆菌转化法
农杆菌中的Ti质粒上的T-DNA(可转移的DNA)转移至受体细胞染色体的DNA上。
第一次基因拼接(人为操作)
第一次导入(人为操作)
第二次导入(利用农杆菌实现)
第二次基因拼接(利用农杆菌实现)
第三步:将目的基因导入受体细——微生物细胞
Ca2+处理目的
可使细胞处于一种能吸收周围环境中DNA分子的生理状态。
受体细胞
(1)原核细胞(常选择大肠杆菌)
(2)优点:繁殖快,多为单细胞,遗传物质相对较少,易于培养。
Ca2+处理法
Ca2+
感受态细胞
吸收
第三步:将目的基因导入受体细——动物细胞
(1)常用方法:
(2)受体细胞:
显微注射法
受精卵
①体积大,易操作。②易表现出全能性。
(3) 过程:
构建基因表达载体并提纯
利用显微注射将基因表达载体注入动物的受精卵中
早期胚胎培养
胚胎移植
获得具有新性状的动物
种类项目 植物细胞 动物细胞 微生物细胞
常用方法 农杆菌转化法;
花粉管通道法 显微注射法 Ca2+处理法
受体细胞 受精卵、体细胞 受精卵 原核细胞
转化过程 目的基因插入Ti质粒的T-DNA上→导入植物细胞→整合到受体细胞DNA中→表达 目的基因表达载体提纯→取受精卵→显微注射→受精卵发育→获得具有新性状的动物 Ca2+处理细胞→感受态细胞→表达载体与感受态细胞混合→感受态细胞吸DNA分子
《金牌》p82
第四步:目的基因的检测与鉴定
《金牌》p83
第四步:目的基因的检测与鉴定
方法1:PCR扩增
转基因生物
提取DNA
DNA作为模板
PCR操作
是否扩增出目的基因
电泳操作
M:marker;1-阳性质粒;
2:原始品系;3-9转Bt品系;
转Bt基因品系PCR琼脂糖凝胶电泳检测结果
DNA半保留复制
原理:
1、检测转基因生物染色体DNA上是否插入了目的基因
第四步:目的基因的检测与鉴定
一段带放射性标记的、与目的基因互补的特异核苷酸序列。可以是DNA,也可以是由之转录而来的RNA,探针的长度可以包括整个基因,或基因的一部分。
基因探针:
原因:带标记的基因探针,与目的基因DNA单链在一定条件下互补配对,结合成双链,从而出现杂交带。
方法2:分子杂交技术
碱基互补配对
原理:
第四步:目的基因的检测与鉴定
RT-PCR
RNA分子杂交(Northern Blot)流程图
过程:用上述探针和转基因生物的mRNA杂交,若出现杂交带,表明目的基因转录出了mRNA。
2、检测目的基因是否转录出了mRNA
第四步:目的基因的检测与鉴定
方法:抗原-抗体杂交技术
苏云金芽孢杆菌
提取
Bt毒蛋白
注射小鼠体内
抗体
标记抗体
提取蛋白
电泳分离
抗原
杂交
转基因生物
抗体
抗原
抗原-抗体杂交带
抗原抗体特异性结合
原理:
3、检测目的基因是否翻译成蛋白质
第四步:目的基因的检测与鉴定
转基因生物 鉴定方法 成功标志
抗虫植物
抗病毒(菌)植物
抗盐植物
抗除草剂植物
饲喂害虫(抗虫接种实验)
害虫死亡
病毒(菌)接种实验
未染病
盐水浇灌
正常生长
喷洒除草剂
正常生长
抗虫鉴定、抗病鉴定、活性鉴定等
4、个体水平鉴定
概念检测
1.研究人员将一种海鱼的抗冻蛋白基因afp整合到土壤农杆菌的Ti质粒上,然后用它侵染番茄细胞,获得了抗冻的番茄品种。判断下列相关表述是否正确。
(1)afp基因是培育抗冻番茄用到的目的基因。
(2)构建含有afp基因的Ti质粒需要限制酶、DNA连接酶和核酸酶。
(3)只要检测出番茄细胞中含有afp基因,就代表抗冻番茄培育成功。
2.利用PCR既可以快速扩增特定基因,也可以检测基因的表达。下列有关PCR的叙述错误的是
A.PCR用的DNA聚合酶是一种耐高温酶
B.变性过程中双链DNA的解开不需要解旋酶
C.复性过程中引物与模板链的结合遵循碱基互补配对原则
D.延伸过程中需要DNA聚合酶、ATP和 4种核糖核苷酸
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课堂小结
Lavf58.29.100
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Lavf59.14.100
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