内容正文:
DNA的粗提取与鉴定、
DNA片段的扩增及电泳鉴定
第2课时
5.1.5 阐明DNA的提取和鉴定的方法和过程
5.1.6 阐明利用聚合酶链式反应(PCR)扩增DNA片段并完成电泳鉴定
课标要求
目录
再认再现——教材基础落实
课时跟踪检测
互动课堂——核心深化学习
再认再现——教材基础落实
一、DNA的粗提取与鉴定
1.基础知识判断
(1)DNA不溶于酒精,但某些蛋白质溶于酒精。 ( )
(2)DNA在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同,它能溶于2 mol/L的NaCl溶液。 ( )
(3)DNA的粗提取时,在漏斗中垫上纱布,将研磨液过滤到烧杯中。 ( )
(4)将丝状物溶解在2 mol/L的NaCl溶液中,加入二苯胺试剂即呈蓝色。 ( )
√
×
√
√
2.基本概念梳理
(1)DNA的粗提取与鉴定的基本原理
不溶于
2
二苯胺
(2)DNA的粗提取与鉴定的方法步骤
95%
沸水
(3)注意事项
①粗提取的DNA丝状物要用滤纸吸去上面的水分或离心得到的沉淀物要晾干,然后再溶解在2 mol/L的NaCl溶液中进行鉴定。
②DNA的溶解度与NaCl溶液浓度有关。实验中鉴定DNA通常用2 mol/L的NaCl溶液溶解DNA,需要不断搅拌以增加DNA的溶解量,通常要3 min以上。
③加入预冷的酒精后,要用玻璃棒缓慢、轻轻地沿一个方向搅拌溶液,玻璃棒不能插入到烧杯的底部。
④二苯胺试剂一般要现用现配,以保证实验的效果。
二、DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.基础知识判断
(1)PCR反应体系中需加入4种脱氧核苷酸作为合成DNA子链的原料。 ( )
(2)用PCR方法扩增目的基因时不必知道基因的全部序列。 ( )
(3)进行DNA片段的扩增及电泳鉴定实验所需的缓冲液和酶应分装成小份,并在20 ℃储存。 ( )
(4)在凝胶中DNA分子的迁移速率与DNA分子的大小和构象等有关,与凝胶的浓度无关。 ( )
√
×
√
×
(5)凝胶中的DNA分子通过染色,可在波长为300 nm的紫外灯下被检测出来。 ( )
(6)某实验利用PCR技术获取目的基因,实验结果显示除目的基因条带(引物与模板完全配对)外,还有2条非特异性条带(引物和模板不完全配对)。提高复性的温度可减少反应非特异性条带的产生。 ( )
√
√
2.基本概念梳理
(1)实验基础
①PCR原理:不仅利用了____________原理,还利用了______________的原理。
②电泳:DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷_____的电极移动,这个过程就是电泳。
③PCR的产物一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定。在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的__________等有关。凝胶中的DNA分子通过_____,可以在波长为_______的_______下被检测出来。
DNA的热变性
DNA半保留复制
相反
大小和构象
染色
300 nm
紫外灯
(2)PCR实验操作步骤
微量移液器
离心管
底部
(3)DNA的电泳鉴定
微量移液器
紫外灯
(4)特别提醒
①线状双链DNA分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量呈反比,分子量越大则所受阻力越大,也越难在凝胶孔隙中移动,因而迁移得越慢,随着时间的推移,就会在凝胶中呈现出一个一个的条带。
②将待测样品电泳条带与Marker(已知长度的DNA片段)进行对比,即可知道待测样品中DNA片段的长度,其中条带的宽度反映了DNA含量的多少。
融通大概念——建构知识体系
互动课堂——核心深化学习
[题点全练]
1.(2024·安徽高考)下列关于“DNA粗提取与鉴定”实验的叙述,错误的是( )
A.实验中如果将研磨液更换为蒸馏水,DNA提取的效率会降低
B.利用DNA和蛋白质在酒精中的溶解度差异,可初步分离DNA
C.DNA在不同浓度NaCl溶液中溶解度不同,该原理可用于纯化DNA粗提物
D.将溶解的DNA粗提物与二苯胺试剂反应,可检测溶液中是否含有蛋白质杂质
核心点(一) DNA的粗提取与鉴定
√
解析:研磨液有利于DNA的溶解并保护DNA不被破坏,若换为蒸馏水,则DNA提取的效率会降低,A正确;DNA不溶于酒精,但细胞中的某些蛋白质溶于酒精,利用这一原理,可初步分离DNA,B正确;DNA在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同,该原理可用于纯化DNA粗提物,C正确;在沸水浴的条件下,DNA遇二苯胺试剂会呈现蓝色,二苯胺试剂用于鉴定DNA,不能检测溶液中是否有蛋白质杂质,D错误。
2.(2024·山东高考)关于“DNA的粗提取与鉴定”实验,下列说法正确的是 ( )
A.整个提取过程中可以不使用离心机
B.研磨液在4 ℃冰箱中放置几分钟后,应充分摇匀再倒入烧杯中
C.鉴定过程中DNA双螺旋结构不发生改变
D.仅设置一个对照组不能排除二苯胺加热后可能变蓝的干扰
√
解析:由教材中“DNA的粗提取与鉴定”实验的方法步骤分析可知,整个提取过程中可以不使用离心机,A正确。研磨液在4 ℃冰箱中放置的目的是获得上清液,不能充分摇匀,B错误。鉴定过程中的沸水浴加热可使DNA双螺旋结构发生改变,C错误。该实验中,为排除二苯胺加热后可能变蓝对实验结果造成干扰,可设置加二苯胺不加DNA的对照组,D错误。
3.(2023·广东高考)“DNA粗提取与鉴定”实验的基本过程是:裂解→分离→沉淀→鉴定。下列叙述错误的是 ( )
A.裂解:使细胞破裂释放出DNA等物质
B.分离:可去除混合物中的多糖、蛋白质等
C.沉淀:可反复多次以提高DNA的纯度
D.鉴定:加入二苯胺试剂后即呈现蓝色
√
解析:DNA主要存在于细胞核内,而裂解的目的是使细胞破裂,释放出DNA等物质,A正确;DNA、RNA、蛋白质和多糖等物质在物理和化学性质方面存在差异,可以利用这些差异,通过适当的分离方法去除混合物中的多糖、蛋白质等,B正确;DNA在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同,通过控制NaCl溶液的浓度使DNA溶解或析出,可反复多次以提高DNA的纯度,C正确;进行DNA鉴定时可以使用二苯胺试剂,但要进行沸水浴加热后才能观察到颜色变化,D错误。
4.图1、图2是“DNA的粗提取与鉴定”实验中的两个操作步骤示意图,下列相关叙述正确的是 ( )
A.图1中溶液a是去掉上清液的研磨液
B.图2所示实验操作中有一处明显错误,可能导致试管2中蓝色变化不明显
C.图1所示操作的原理是DNA能溶于酒精,而蛋白质等杂质不溶
D.图2试管1的作用是证明物质的量浓度为2 mol/L的NaCl溶液遇二苯胺出现蓝色
√
解析:图1中溶液a是研磨液静置几分钟后取的上清液,A错误;图2所示实验的试管中溶液的液面高于烧杯中的液面,可能导致加热不充分,试管2中蓝色变化不明显,B正确;图1所示操作的原理是DNA不能溶于酒精,而蛋白质等杂质能溶于酒精,C错误;图2试管1起对照作用,目的是证明沸水浴条件下物质的量浓度为2 mol/L的NaCl溶液遇二苯胺不会出现蓝色,D错误。
[题后悟法]
1.DNA粗提取与鉴定中不同试剂的用途及原理
试剂 浓度 用途 主要原理
NaCl
溶液 2 mol/L 溶解
DNA DNA在NaCl溶液中的溶解度随溶液浓度的变化而改变,溶解度在2 mol/L时最大
酒精 95%(体积
分数) 除去杂质、
析出DNA DNA不溶于酒精,但是细胞中的某些物质可溶于酒精
二苯胺
试剂 — 鉴定
DNA DNA遇二苯胺试剂(沸水浴)会变蓝色
2.DNA与蛋白质在不同浓度NaCl溶液中的溶解度
物质 溶解规律 NaCl溶液浓度
2 mol/L 0.14 mol/L
DNA 溶解 析出
蛋白质 NaCl溶液物质的量浓度从2 mol/L逐渐降低的过程中,溶解度逐渐增大 部分发生
盐析沉淀 溶解
[题点全练]
题点1 DNA片段的扩增中引物的设计
1.(2024·山东高考)制备荧光标记的DNA探针时,需要模板、引物、DNA聚合酶等。在只含大肠杆菌DNA聚合酶、扩增缓冲液、H2O和4种脱氧核苷酸(dCTP、dTTP、dGTP和碱基被荧光标记的dATP)的反应管①~④中,分别加入如表所示的适量单链DNA。已知形成的双链DNA区遵循碱基互补配对原则,且在本实验的温度条件下不能产生小于9个连续碱基对的双链DNA区。能得到带有荧光标记的DNA探针的反应管有( )
核心点(二) DNA片段的扩增及电泳鉴定
反应管 加入的单链DNA
① 5'-GCCGATCTTTATA-3';
3'-GACCGGCTAGAAA-5'
② 5'-AGAGCCAATTGGC-3'
③ 5'-ATTTCCCGATCCG-3';
3'-AGGGCTAGGCATA-5'
④ 5'-TTCACTGGCCAGT-3'
A.①② B.②③ C.①④ D.③④
√
解析:分析反应管①~④中分别加入的适量单链DNA可知,①中两条单链DNA分子之间具有互补的序列(10个连续碱基对),但双链DNA区之外的3'端无模板,因此无法进行DNA合成,不能得到带有荧光标记的DNA探针;②中单链DNA分子内具有互补的序列,由于在本实验的温度条件下不能产生小于9个连续碱基对的双链DNA区,故该条单链DNA分子不发生自身环化,但两条链可以形成双链DNA区,由于DNA合成的序列(5'-TCT-3')中不含碱基A,不能得到带有荧光标记的DNA探针;
③中两条单链DNA分子之间具有互补的序列(10个连续碱基对),且双链DNA区之外的5'端有凸出的碱基(含碱基T),因此进行DNA合成能得到带有荧光标记的DNA探针;④中单链DNA分子内具有自身互补的序列,结合题中信息知该条单链DNA分子不发生自身环化,两条链可以形成双链DNA区,且双链DNA区之外的5'端有凸出的碱基(含碱基T),因此进行DNA合成能得到带有荧光标记的DNA探针。综上,能得到带有荧光标记的DNA探针的反应管有③④,故选D。
2.图1是利用PCR技术扩增目的基因的示意图,表中是使用引物中的碱基序列。
(1)PCR中使用的DNA聚合酶与一般生物体内的
DNA聚合酶相比,特点是_______,其作用是_______
___________________________________________。
引物对A P1 AACTGAAATGTAGCTATC
P2 TTAAGTCCATTACTCTAG
引物对B S1 GTCCGACTAGTGGCTGTG
S2 AGCTGGCGTTTAGCCTCG
耐高温
将单个
脱氧核苷酸连续结合到双链DNA片段的引物链上
解析:(1)由于在PCR扩增技术中采用高温使DNA变性解旋,因此需要使用的DNA聚合酶具有耐高温的特点,DNA聚合酶将单个脱氧核苷酸连续结合到双链DNA片段的引物链上,催化合成DNA子链。
(2)图中引物为单链DNA片段,它是子链合成延伸的基础。在第四轮循环产物中不含有引物1的DNA片段所占的比例为____,出现__个两条脱氧核苷酸链等长的DNA片段。
解析: (2)由图1可知,由原来的每条母链为模板合成的两个新DNA分子中,只含有引物1或引物2,而以新合成的子链为模板合成新DNA分子时,两种引物都含有,故第四轮循环共产生16个DNA分子,其中含有引物1的DNA分子是15个,不含引物1的DNA分子是1个,占1/16。在PCR反应过程中,第三轮循环出现两个等长的DNA,经过第四次复制产生4个等长的DNA,另外有四个DNA通过第四次复制也会分别产生一个等长的DNA,即共有8个等长的DNA。
1/16
8
(3)PCR过程中复性温度必须根据引物的碱基数量和种类来设定。上表为两对引物序列,________可采用较高复性温度,原因是______________。
解析: (3)PCR过程中复性温度必须根据引物的碱基数量和种类来设定。据题表可知,表中的两对引物序列中引物对B中C、G的比例高,可采用较高的复性温度。
引物对B
C、G的比例高
(4)设计引物是PCR技术关键步骤之一。某同学设计的两组引物(只标注了部分碱基序列)都不合理(图2),请分别说明理由:第1组:_________
_________________________________;第2组:______________________
_______________________。
引物Ⅰ和引物Ⅱ局部发生碱基互补配对而失效
引物Ⅲ自身折叠后会出现局部碱基互补配对而失效
解析:(4)第1组:分析图2中引物可知,引物Ⅰ的部分碱基序列是CAGGCT,引物Ⅱ的部分碱基序列是AGCCTG,引物Ⅰ和引物Ⅱ的局部碱基之间存在互补配对关系,若利用这两个引物进行DNA扩增,会因其中的部分碱基发生碱基互补配对而使引物失效。第2组:引物Ⅲ的部分碱基序列是AACTG和CAGTT,两侧碱基具有碱基互补配对关系,该引物一旦发生自身折叠,也将会出现部分碱基发生碱基互补配对而使引物失效。
题点2 DNA片段的扩增及电泳鉴定实验过程
3.(2024·黑吉辽卷)关于采用琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物的实验,下列叙述正确的是( )
A.琼脂糖凝胶浓度的选择需考虑待分离DNA片段的大小
B.凝胶载样缓冲液中指示剂的作用是指示DNA分子的具体位置
C.在同一电场作用下,DNA片段越长,向负极迁移速率越快
D.琼脂糖凝胶中的DNA分子可在紫光灯下被检测出来
√
解析:琼脂糖凝胶的浓度、待测样品中DNA分子的大小和构象等都会影响DNA分子在电泳中的迁移速率,故琼脂糖凝胶浓度的选择需考虑待分离DNA片段的大小,A正确;在电泳过程中,凝胶载样缓冲液中的指示剂不会与DNA结合,而是随着电流的通过而移动,可用于确定样品的迁移方向和距离,不能用于指示DNA分子的具体位置,B错误;在同一电场作用下,DNA片段越长,即DNA相对分子质量越大,迁移速率越慢,C错误;琼脂糖凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300 nm 的紫外灯下被检测出来,D错误。
4.在基因工程操作过程中,科研人员利用识别两种不同序列的限制酶(R1和R2)处理基因载体,进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果如图所示。以下相关叙述错误的是 ( )
A.该载体最可能为环状DNA分子
B.两种限制酶在载体上各有一个酶切位点
C.限制酶R1与R2的切点最短相距约400 bp
D.限制酶作用位点会导致磷酸二酯键断裂
√
解析:当仅用一种限制酶切割载体时,两种限制酶切割产生的DNA片段等长,而两种限制酶同时切割时则产生两种长度的DNA片段,因此该载体最有可能为环状DNA分子,两种限制酶在载体上各有一个酶切位点,A、B正确;两种限制酶同时切割时则产生600 bp和200 bp两种长度的DNA片段,所以两种限制酶的酶切位点最短相距200 bp,C错误;限制酶切割DNA分子,破坏的是作用位点上两个脱氧核苷酸之间的磷酸二酯键,D正确。
[题后悟法]
1.PCR中使用的引物应具备的特点
(1)引物能与DNA模板碱基互补配对。
(2)2种引物之间不能有互补的碱基序列,避免引物形成双链,导致扩增失败。
(3)某一引物不能存在自身局部碱基序列互补配对,避免自身折叠出现配对,无法和模板DNA结合。
(4)多数情况需要在2种引物的5'端添加不同限制酶识别的碱基序列,扩增出的DNA片段可以使用相应限制酶切割后与载体正向连接。
(5)引物不能太短,以防扩增出非特异性DNA片段(非目的基因)。
2.DNA片段扩增及电泳鉴定实验的注意事项
(1)为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
(2)缓冲液和酶应分装成小份,并在-20 ℃条件下储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
(3)在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换,避免试剂的污染。
(4)在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
(5)观察DNA带的分布及粗细程度来评价扩增的效果。
3.DNA片段鉴定的原理
(1)DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳。
(2)在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象等有关。
(3)凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300 nm的紫外灯下被检测出来。
根据PCR反应过程示意图分析下列问题:
主攻学困点——强化规范表达
1.PCR技术的原理是什么?
提示:DNA半保留复制(体外DNA双链复制)。
2.由图分析可知,在PCR反应过程中需要两种引物,原因是什么?
提示:DNA由两条反向平行的脱氧核苷酸链组成,DNA聚合酶不能从头合成DNA,而只能从3'端延伸DNA链。
3.DNA片段电泳鉴定的原理是什么?
提示:DNA分子在碱性条件下(pH=8.0的缓冲液)带负电,在电场力的驱动下,从负极向正极在琼脂糖凝胶的孔洞中移动;核酸染料带正电,在电场力的驱动下,从正极向负极运动,遇到DNA就嵌入其中完成染色,但这个颜色在可见光下看不到,需要紫外光激发。
4.电泳鉴定时未出现特异性条带的原因有哪些?
提示:模板DNA出现污染;Taq DNA聚合酶出现质量问题;引物特异性不强(如与非目的序列有同源性)或形成引物二聚体;PCR循环次数过少等。
课时跟踪检测
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