内容正文:
第2课时
DNA片段的扩增及电泳鉴定
第3章 基因工程
人教版高中生物 选择性必修3
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
PCR仪器
电泳结果
电泳装置
PCR→PCR产物 电泳
鉴定
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
第一部分 DNA片段的扩增
1.DNA片段扩增原理
利用PCR在体外进行DNA半保留复制
①PCR利用了DNA热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合。
5’
3’
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3’
5’
5’
3’
5’
3’
3’
94˚C变性
延伸
复性
55
˚C
72˚C
1次循环
②PCR仪能够自动调控温度,一次PCR一般要经历30次循环。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
2.PCR过程使用的材料用具
PCR仪
微量离心管
一次性吸液枪头
微量移液器
自动控温,实现DNA的扩增
实际上是进行PCR反应的场所
用于向微量离心管转移PCR配方中的液体
微量移液器吸取一种试剂更换一次枪头
试剂
扩增缓冲液(Mg2+)、4种脱氧核苷酸等量混合液、2种引物、TaqDNA聚合酶、模板DNA、无菌水。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
3.DNA片段扩增的具体过程
移 液
用 按照PCR反应体系配方或PCR试剂盒的说明书,在 中依次加入各组分
离 心
待所有组分都加入后, 离心管的盖子,将微量离心管放入 里,离心约10s,使反应液集中在离心管的 (提高反应速率)
反 应
参照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
微量移液器
微量离心管
盖严
离心机
底部
可根据目的基因片段长度适当调整延伸时间
预变性:使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性
94℃,5min
/
/
30次
94℃,30s
55℃,30s
72℃,1min
最后一次
94℃,1min
55℃,30s
72℃,1min
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
第二部分 琼脂糖凝胶电泳
1.电泳的原理
①电泳:在电场作用下,带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程称为电泳。
③PCR的产物一般通过_________________来鉴定。
②在碱性缓冲溶液中,DNA分子带负电,电泳时DNA从负极向正极迁移。
琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖:0.8%~1.2%
凝胶孔径的大小与琼脂糖的浓度呈负相关
琼脂糖凝胶是一种带孔的筛网状多聚物,其浓度直接影响凝胶筛孔的大小,进而影响DNA分子的迁移速率。具体来说,琼脂糖浓度越小,筛孔越大,DNA分子迁移速率就越高;相反,凝胶浓度越大,筛孔越小,DNA分子迁移速率就越低。这是因为DNA的分子大小与线状双链DNA分子在特定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中蠕行,因而迁移得越慢。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
1.电泳的原理
电源
+
—
电泳槽
缓冲液
琼脂糖凝胶
加样孔
④影响DNA迁移速率的因素
a.与凝胶的浓度呈负相关
b.与DNA分子大小呈负相关
c.与DNA分子构象有关
相同分子量的线状、开环和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度是不一样的,其中超螺旋DNA移动最快,而线状双链DNA移动最慢。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
第二部分 琼脂糖凝胶电泳
凝胶中DNA分子通过染色,在波长为300nm的紫外灯下被检测出来。
⑤电泳结果的显示
1.电泳的原理
在同一浓度的凝胶中,较小的DNA片段迁移速度比大片段快。
电泳一般需要留一个加样孔加入标准参照物(Marker),为一组已知分子量的标准DNA片段,在电泳中作为未知样品大小的参照物。
Marker
小DNA片段
大DNA片段
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
2.琼脂糖凝胶电泳过程使用的材料用具
DNA样品+指示剂
琼脂糖+核酸染料
电泳缓冲液
呈现颜色,便于加样;指示样品迁移的速率及方向
紫外灯下显影DNA条带
维持PH值稳定
指示DNA大小的标准参照物
用具
电泳装置(电泳仪、电泳槽等)、微量移液器、一次性吸液枪头
试剂
Marker
3.PCR扩增产物电泳鉴定的具体过程
制备凝胶
①融化
②倒模
③凝固
用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
进行电泳
①加液
②加样
③电泳
将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物。
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳
观察鉴定
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
4.实验结果及分析评价
[思考1]你是否成功扩增出DNA片段?
判断的依据是什么?
以在紫外灯下直接观察到DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。进行电泳鉴定的结果应该是一条条带。
该片段大小约为750bp。
[思考2]你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。
①如果扩增不成功,可能的原因有:
漏加了PCR的反应成分,各反应成分的用量不当,PCR程序设置不当等。
②如果扩增结果不止一条条带,可能的原因有:
引物设计不合理,它们与非目的序列有同源性或容易形成二聚体;复性温度过低;DNA聚合酶的质量不好;模板DNA出现污染;Mg2+浓度过高等。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究.实践
注意事项
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、
枪头和蒸馏水等在使用前必须进行 处理。
2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,
并在 储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的
枪头都必须 。
4.在进行操作时,一定要 。
5.PCR扩增不能随意加大试剂用量。
高压灭菌
-20℃
更换
戴好一次性手套
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