内容正文:
第3章 基因工程
第2节 基因工程的基本操作程序
第3课时 探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
高中生物选择性必修3 生物技术与工程
实验原理
材料用具
实验步骤
DNA体外扩增的原理
DNA片段电泳鉴定原理
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.利用PCR在体外进行DNA片段扩增的原理
一、实验原理
(1)PCR利用了DNA的热变性原理,通过
调节温度来控制DNA双链的解聚与
结合,PCR仪实质上就是一台能够
自动调控温度的仪器。
(2)PCR扩增DNA片段还利用了DNA半保
留复制的原理。一次PCR一般要经
历30次循环。
变性
超过90˚C
延伸
72˚C左右
复性
50˚C左右
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
(1)DNA分子具有______________,在一定的
________下,这些基团可以带上正电荷或负
电荷,在电场的作用下,这些带电分子会向
着_______________________的电极移动,这
个过程就是__________;
可解离的基团
pH
电泳
与它所带电荷相反
(2) PCR的产物一般通过__________________来鉴定;
(3) 在凝胶中DNA分子的迁移速率与___________、_____________和_____等有关
(4) 凝胶中的DNA分子通过_____,可以在波长为________的______下被检测出来。
琼脂糖凝胶电泳
凝胶的浓度
DNA分子的大小
构象
染色
300nm
紫外灯
2.DNA片段电泳鉴定的原理
一、实验原理
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
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DNA分子中的磷酸基团能解离出氢离子,剩下的部分(DNA的磷酸残基)带负电荷,因此DNA分子可从负极向正极迁移,DNA分子量越大,迁移的越慢。
分子量大
(长片段)
分子量小
(短片段)
Marker: DNA分子量标准
2.DNA片段电泳鉴定的原理
一、实验原理
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
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三、材料用具
PCR仪
微量离心管
电泳装置
微量移液器
自动控温,实现DNA的扩增
实际上是进行PCR反应的场所
用于向微量离心管转移PCR配方中的液体
包括电泳仪、电泳槽等
1.仪器
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
①4种脱氧核苷酸等量混合液、2种引物、TaqDNA聚合酶、模板DNA、
扩增缓冲液、无菌水。
③PCR反应体系的配方(见教材P84)
②电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖和核酸染料等。
三、材料用具
2.材料
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
加 样
离 心
扩 增
四、方法步骤
1.DNA片段的扩增
用微量移液器按照PCR反应体系配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分
材料 用量
10倍浓缩的扩增缓冲液(含Mg2+) 5μL
20mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液(实为dNTP) 1μL
20μmol/L的引物Ⅰ 2.5μL
20μmol/L的引物Ⅱ 2.5μL
H2O 28~33μL
1-5U/μL的Taq DNA聚合酶
(即耐高温的DNA聚合酶) 1~2U
模板DNA (用量为1pg-1μg) 5~10μL
注意:酶和缓冲液要在冰块上缓慢融化,用后置于-20℃冰箱中保存。酶和缓冲液一般分装成小份,避免反复融化导致活性降低甚至失活。
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
加 样
离 心
扩 增
四、方法步骤
1.DNA片段的扩增
待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子,将微量离心管放入离心机里,离心约10s,使反应液集中在离心管的底部
(提高反应速率)
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
加 样
离 心
扩 增
四、方法步骤
1.DNA片段的扩增
参照表中参数,设置好PCR仪的循环程序。
将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃,5min
30次 94℃,30s 55℃,30s 72℃,1min
最后1次 94℃,1min 55℃,30s 72℃,1min
可根据目的片段长度适当调整延伸时间
预变性:使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合。
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
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制备凝胶
观察鉴定
四、方法步骤
进行电泳
2.DNA片段的电泳鉴定
电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
①熔化:
②倒模:
③凝固:
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
制备凝胶
观察鉴定
四、方法步骤
进行电泳
2.DNA片段的电泳鉴定
将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜
扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物。
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳
①加液
②加样
③电泳
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
制备凝胶
观察鉴定
四、方法步骤
进行电泳
2.DNA片段的电泳鉴定
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和
蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在
-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪
头都必须更换。
4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
5.PCR扩增不能随意加大试剂用量。
五、注意
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
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1.你是否成功扩增出DNA片段?判断的依据是什么?
以在紫外灯下直接观察到DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。
该片段大小约为750bp。
六、结果分析与评价
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
2.你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因?
未出现扩增条带可能的原因有:
①TaqDNA聚合酶失活;
②引物出现质量问题;
③变性时温度低,变性时间短
④Mg2+浓度过低
出现非特异性扩增带可能的原因有:
①引物特异性不强或容易聚合成二聚体
②复性时的温度过低
③DNA聚合酶的浓度过高
④模板DNA出现污染
⑤Mg2+浓度过高
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.用A和B两种限制酶同时和分别处理同一DNA片段,限制酶对应切点一定能切开。两种酶切位点及酶切产物电泳分离结果如图1和图2所示。下列叙述错误的是( )
A.用A和B两种限制酶同时处理图中同一DNA片段得到6个游离的磷酸基团
B.图1中X代表的碱基对数为4500,Y是限制酶A的酶切位点
C.电泳凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子大小和构象等有关
D.设计引物从图1中完整DNA片段中扩增出完整X,至少需要3次PCR
A
习题巩固
2.DNA测序时,先将待测单链DNA模板、引物、有关酶、4种脱氧核苷三磷酸(dNTP,N代表A、T、C、G,能提供能量并作为DNA复制的原料)均加入4个试管中,再分别加入一定量的含放射性同位素标记的ddNTP(ddGTP、ddATP、ddCTP、ddTTP)。不同于dNTP的是,ddNTP的五碳糖的3位不含羟基。在DNA合成时ddNTP随机与dNTP竞争核苷酸链延长位点,并终止DNA的延伸,从而形成不同长度的一系列终止处带有放射性同位素标记的DNA链。下图是DNA测序时得到含放射性标记的子代DNA的电泳图谱。下列相关说法错误的是( )
A.图中加入ddCTP的一组中,可以形成3种长度的子链
B.图中子代DNA的碱基序列是5'-GATCCGAAT-3'
C.反应体系中的引物为单链,DNA聚合酶从引物的3'端
连接脱氧核苷酸
D.dNTP终止子链延伸,其原理可能是其五碳糖的3'位不
含羟基,无法连接新的脱氧核苷酸
B
习题巩固
3.用PCR方法检测转基因植株是否成功导入目的基因时,得到以下电泳图谱,其中1号为DNA标准样液(Marker),10号为蒸馏水。PCR时加入的模板DNA如图所示。据此做出分析不合理的是( )
A.PCR产物的分子大小
在250至500bp之间
B.3号样品为不含目的
基因的载体DNA
C.9号样品对应植株不是
所需的转基因植株
D.10号的电泳结果能确定反应体系等对实验结果没有干扰
B
习题巩固
解析 PCR过程中,可以通过设计特定的引物来扩增特定的DNA片段。4~9号是转基因植株,理论上应包含目的基因,结合2号野生型和10号蒸馏水组的结果,推测包含目的基因的片段大小应为250~500 bp,A正确;3号PCR结果包含250~500 bp片段,应包含目的基因,B错误;9号PCR结果不包含250~500 bp片段,所以不是所需转基因植株,C正确;10号放入蒸馏水,可排除反应体系等对结果的干扰,由图可知,10号的电泳结果能确定反应体系等对实验结果没有干扰,D正确。
20
Lavf58.29.100
Bilibili VXCode Swarm Transcoder v0.6.10
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