内容正文:
探究·实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
一、实验原理
1.DNA片段的扩增
PCR利用了__DNA的热变性__原理,通过调节__温度__来控制DNA双链的__解聚与结合__。
2.琼脂糖凝胶电泳
(1)带电粒子:DNA分子具有__可解离__的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上__正电荷__或__负电荷__。
(2)迁移动力与方向:在__电场__的作用下,带电分子会向着与它所带电荷__相反__的电极移动,这个过程就是电泳。
(3)迁移速率:在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的__浓度__、DNA分子的__大小__和__构象__有关。
(4)检测:凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300 nm的__紫外__灯下被检测出来。
二、方法步骤
1.移液:用__微量移液器__按照配方或PCR试剂盒的说明书,在__微量离心管__中依次加入各组分。
2.混合:待所有的组分都加入后,盖严离心管的盖子。
3.离心:将微量离心管放在离心机上,离心约__10__s,使反应液集中在管的__底部__。
4.反应:将装有反应液的微量离心管放入__PCR仪__中,设置好循环程序进行反应。
5.根据待分离的DNA片段的__大小__,用__电泳缓冲液__配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积为__0.8%~1.2%__的琼脂糖溶液,并加入适量的__核酸__染料混匀。
6.将扩增得到的PCR产物与__凝胶载样缓冲液__(内含指示剂)混合,再用__微量移液器__将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。
7.接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为__1~5__V/cm。待指示剂前沿迁移接近__凝胶边缘__时,停止电泳。
8.电泳结束后,取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
三、操作提示
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行__高压灭菌__处理。
2.缓冲液和酶应分装成小份,并在__-20_℃__储存。使用前将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上__缓慢__融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
四、关键点拨
1.未出现扩增条带的主要原因
(1)Taq DNA聚合酶失活。
(2)引物出现质量问题。
(3)Mg2+浓度过低。
(4)变性时的温度__低__,_变性时间短。
2.出现非特异性扩增条带的主要原因
(1)模板DNA出现__污染__。
(2)引物特异性不强或形成引物二聚体。
(3)Mg2+浓度__过高__。
(4)复性时的温度__过低__等。
【例1】 下列有关电泳的叙述,不正确的是( )
A.电泳是指带电粒子在电场的作用下发生迁移的过程
B.待测样品中DNA分子的大小和构象、凝胶的浓度等都会影响DNA在电泳中的迁移速率
C.进行电泳时,带电分子会向着与其所带电荷相同的电极移动
D.PCR的产物一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定
答案 C
解析 由于同性相斥、异性相吸,带电分子会向着与其所带电荷相反的电极移动,C项错误。
【例2】 (2024·6月浙江)阅读下列材料,完成下面小题。
疟疾是一种严重危害人类健康的红细胞寄生虫病,可用氯喹治疗。疟原虫pfcrt基因编码的蛋白,在第76位发生了赖氨酸到苏氨酸的改变,从而获得了对氯喹的抗性。对患者进行抗性筛查,区分氯喹敏感患者和氯喹抗性患者,以利于分类治疗。
研究人员根据pfcrt基因的序列,设计了F1、F2、R1和R2等4种备选引物,用于扩增目的片段,如图甲所示。为选出正确和有效的引物,以疟原虫基因组DNA为模板进行PCR,产物的电泳结果如图乙所示。
1.下列关于引物F1、F2、R1和R2的叙述,错误的是( )
A.F1-R1引物可用于特异性地扩增目的片段
B.F1-R2引物不能用于特异性地扩增目的片段
C.F2为无效引物,没有扩增功能,无法使用
D.R2引物可用于特异性地扩增目的片段
答案 D
解析 根据图乙结果显示可知,F1-R1引物只扩增出一条片段,说明能够用于特异性扩增目的片段,A项正确;根据图乙信息可知,F1-R2引物扩增条带为三条,说明其不能用于特异性扩增目的片段,B项正确;根据图乙信息可知,F1-R1能扩增目的1条带,F2-R1无法扩增目的条带,所以F2为无效引物,没有扩增功能,无法使用,C项正确;根据图乙结果显示可知,F1-R1引物只扩增出一条片段,F1-R2引物扩增条带为三条,说明R2引物无法特异性的扩增目的条带,D项错误。
2.为了筛查疟原虫感染者,以及区分对氯喹的敏感性。现有6份血样,处理后进行PCR。产物用限制酶ApoⅠ消化,酶解产物的电泳结果如图所示。
1~6号血样中,来自于氯喹抗性患者的是( )
A.1号和6号
B.2号和4号
C.3号和5号
D.1号、2号、4号和6号
答案 B
解析 根据题干信息可知,疟原虫pfcrt基因编码的蛋白,在第76位发生了赖氨酸到苏氨酸的改变,从而获得了对氯喹的抗性。根据酶切位点可知,在具有氯喹抗性的基因组没有ApoⅠ酶切位点,而敏感性基因组中具有该酶切位点,因此对6份血样处理后进行PCR,产物用限制酶ApoⅠ消化,酶解产物的电泳出现两条带则为敏感型,只有一条带的为抗性,所以1~6号血样中,来自于氯喹抗性患者的是2号和4号,B项正确。
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