内容正文:
DNA的粗提取及鉴定
知识目标:理解DNA粗提取和鉴定的原理。
能力目标: (1) 初步掌握DNA粗提取和鉴定的方法; (2) 在对实验原理、步骤的理解和分析过程中培养科学思维; (3) 熟悉粗提取生物大分子的一般性方法。
、情感、态度与价值观目标:在实验过程中培养严谨细致、实事求是的科学态度。
教学重难点:DNA的粗提取和鉴定的方法及原理。
1
一、实验原理:
(1)DNA不溶于酒精,但某些蛋白质溶于酒精。
(2)DNA在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同,能溶于2mol/L NaCl溶液。
DNA、RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质方面存在差异,可以利用这些差异,选用适当的物理或化学方法去除其他成分,对DNA进行提取。
(1)通过对DNA粗提取和鉴定的原理的学习,能够说明DNA粗提取每一步骤的原因。
(2)能够阐述DNA粗提取和鉴定的流程,总结生物大分子粗提取的一般步骤
2
构成染色体的核蛋白加速解聚,游离出DNA分子,并使DNA分子充分溶解于Nacl溶液中。
Nacl溶液为2mol/L时,DNA溶解,而部分蛋白质发生盐析生成沉淀,通过过滤,可除去部分蛋白质及不溶于Nacl溶液的杂质
Nacl溶液为0.14mol/L时,DNA析出,过滤可除去溶于Nacl中的部分蛋白质和杂质。
Nacl
蛋白质在Nacl溶液浓度从2mol/L降低的过程中,溶解度逐渐增大
如何DNA溶解在上清液中呢?
极性蛋白质
解释曲线
三个方法
3
一、实验原理:
(1)DNA不溶于酒精,但某些蛋白质溶于酒精。
(2)DNA在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同,能溶于2mol/L NaCl溶液。
(3)在一定温度下,DNA遇二苯胺试剂会呈现蓝色。
DNA、RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质方面存在差异,可以利用这些差异,选用适当的物理或化学方法去除其他成分,对DNA进行提取。
(鉴定)
(现用现配)
沸水浴加热
(1)通过对DNA粗提取和鉴定的原理的学习,能够说明DNA粗提取每一步骤的原因。
(2)能够阐述DNA粗提取和鉴定的流程,总结生物大分子粗提取的一般步骤
4
1.选择适宜的材料
2.破碎细胞
4.提纯
5.验证
3.提取
二、实验思路
1.选材:
新鲜洋葱
为什么用洋葱呢,其他实验材料可以吗?
三、实验步骤
红细胞
成熟的红细胞
这些生物组织是否适宜用作实验材料?
选材:新鲜 洋葱,菠菜,菜花,香蕉,草莓
新鲜的猪肝,鱼白(鱼的精巢)?冷藏或冷冻保存
不能选的时成熟的红细胞?
鱼类的精巢又叫鱼白,是鱼制造和贮存精子的器官。鱼白含有一种特殊的蛋白质,叫鱼精蛋白,是自然界中最简单的一种碱性蛋白质。它是止血的良药
鸡血的保存环境有严格要求,并且实验中去杂质的过程需要反复地进行过滤操作,DNA含量高,血细胞已破碎处理
洋葱易取材,成本低,操作简单且成功率高,但研磨较麻烦,且有刺激性气味;而猕猴桃原料价钱略高,但不用研磨,无辣味、去皮后用纱布挤压即可,较适合开展此实验
菠菜呈现绿色,影响鉴定效果;草莓价格昂贵,成本较高
菜花为实验原料,由于它的硬度较高,容易出现研磨不充分,研磨时间过长产生的热量会影响DNA的提取量,纤维素酶?洋葱,气味刺激,护目镜,通风。植物的叶蛋白 氯仿多糖低温暗处?合成少CTAB,多酚类物质极易被氧化成褐色物质醌类,醌能够形成游离的自由基,这种自由基能够引起磷酸二酯键的断裂,造成基因组DNA完整性的破坏以及序列长度的降低;丹宁,色素提取DNA方法不同
7
DNA含量相对较高的生物组织,如新鲜洋葱、香蕉、菠菜、菜花和猪肝等
不能选择哺乳动物成熟的红细胞,因为哺乳动物成熟的红细胞中没有细胞核和线粒体,不含DNA
1.选材:
注意:
操作步骤简便
实验材料是否容易保存等
实验经费
1.选材:
实验试剂:研磨液
2.破碎细胞
实验工具:研钵
EDTA(乙二胺四乙酸):是一种能与二价金属离子结合的螯合剂,而大多数核酸酶需要镁离子,因此可以作为DNA酶的抑制剂,防止细胞破碎后DNA酶降解DNA。
Tris-Hcl(三羟甲基氨基甲烷盐酸盐):缓冲体系,DNA在这个缓冲体系呈稳定状态。(ph=8)
SDS(十二烷基硫酸钠):是一种阴离子去污剂,可以裂解细胞。 常见于洗涤剂
研磨液的成分
使蛋白质变性,染色体解离。
2mol/LNacl: 溶解DNA
直接加水研磨可以吗?溶酶体的酶会释放,所以我们要加一种物质EDTA,它可以和螯合大多数核酸酶所需的辅助因子镁离子,
除此之外呢?稳定的环境
DNA就释放分离出来了吗?染色体形式,还需要把DNA与蛋白质分离
10
董 文惠 (董) -
1.选材:
实验试剂:研磨液
使蛋白质变性与DNA分离,防止细胞破碎后DNA酶降解DNA,
DNA在缓冲体系中呈稳定状态
2.破碎细胞
实验工具:研钵
2.破碎细胞
?
研磨液
破碎细胞,使核物质容易溶解在研磨液中
直接加水研磨可以吗?溶酶体的酶会释放,所以我们要加一种物质EDTA,它可以和螯合大多数核酸酶所需的辅助因子镁离子,
除此之外呢?稳定的环境
DNA就释放分离出来了吗?染色体形式,还需要把DNA与蛋白质分离
DNA会被吸附到滤纸上,,解释RNA,糖类
上清液有放入DNA,RNA,蛋白质,脂质,糖类只占1%
称取约30g洋葱,切碎,然后研钵中,倒入10ml的研磨液,充分研磨。如果研磨不充分,会对结果造成怎样的影响
在漏斗上垫上纱布?,将洋葱研磨液过滤到烧杯中,在4°C冰箱中放置几分钟,再取上清液。也可以直接将洋葱研磨液倒入塑料离心管中,在1500r/min的转速下离心5min,再取上清液放入烧杯中。
12
3.提取DNA(过滤或者离心)
?
上清液中有什么物质呢?
DNA会被吸附到滤纸上
直接加水研磨可以吗?溶酶体的酶会释放,所以我们要加一种物质EDTA,它可以和螯合大多数核酸酶所需的辅助因子镁离子,
除此之外呢?稳定的环境
DNA就释放分离出来了吗?染色体形式,还需要把DNA与蛋白质分离
DNA会被吸附到滤纸上,,解释RNA,糖类
上清液有放入DNA,RNA,蛋白质,脂质,糖类只占1%
称取约30g洋葱,切碎,然后研钵中,倒入10ml的研磨液,充分研磨。如果研磨不充分,会对结果造成怎样的影响
在漏斗上垫上纱布?,将洋葱研磨液过滤到烧杯中,在4°C冰箱中放置几分钟,再取上清液。也可以直接将洋葱研磨液倒入塑料离心管中,在1500r/min的转速下离心5min,再取上清液放入烧杯中。
13
DNA不溶于酒精,但有些蛋白质,脂质溶于酒精。
在上清液中加入体积相等的、预冷的酒精溶液(体积分数为95%),静置2-3min,溶液中会出现的白色丝状物就是粗提取的DNA。
预冷的酒精:
一是抑制核酸水解酶的活性,防止DNA 降解;
二是降低分子运动,易于形成沉淀析出;
三是低温有利于增加DNA分子的柔韧性,减少断裂
4.纯化
14
用玻璃棒沿一个方向搅拌,卷起丝状物,并用滤纸吸去上面的水分;或者将溶液倒入塑料离心管中,在10000r/min的转速下离心5min,弃上清液,将管底的沉淀物晾干。
搅拌时应轻缓、并沿一个方向:
减少DNA断裂,以便获得较完整的DNA分子
如果不是白色丝状物,说明DNA中的杂质较多。
4.纯化
无水乙醇昂贵
蛋白质还有什么去除方法
糖类低温,昏暗
15
用高浓度盐溶液溶解DNA,可以去除在高盐中不能溶解的杂质;用低盐浓度使DNA析出,能除去溶解在低盐溶液中的杂质。
因此,通过反复溶解和析出DNA,就能够除去与DNA溶解度不同的多种杂质。
还有什么方法去除杂质?
可以补充一下蛋白酶和高温
16
二苯胺
试管编号 A组(对照组) B组(实验组)
步骤1 物质的量浓度为2mol/L的Nacl溶液5ml
步骤2 不进行任何处理 加丝状物或沉淀物
步骤3 加4ml二苯胺试剂,混匀
步骤4 沸水浴加热5min
实验现象
4.鉴定(定性)
如果不呈现蓝色,可能的原因有所提取的DNA含量低,或者在实验操作过程中出现了失误等。
溶液不变蓝
溶液逐渐变为蓝色
微溶解于水,易溶解于酒精、冰乙酸等有机溶剂
17
了解—鉴定(定量)
原理:
DNA溶液与二苯胺试剂作用生成蓝色化合物,在一定波长范围内,化合物蓝色的深浅与DNA的含量成比例关系,可用比色法测定。
分光光度计
使用步骤
20
入射光强度 Io
透射光强度 I
样品池
(吸收池)
检测器及仪表
单色器
光源
工作原理
21
1.标准曲线的绘制
取干燥的试管6支,编号,按下表加入试剂:
混匀,在60度水浴中保温45分钟,冷却后,在595nm波长下测吸光度,以吸光度对DNA浓度作标准曲线。
0 1 2 3 4 5
DNA标准液 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
蒸馏水 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 0
二苯胺试剂 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0
方法步骤
绘制一下简单的标准曲线
22
2.样品测定
吸取DNA样液1ml,加入二苯胺溶液2.0ml,加毕,混匀,在60度水浴中保温45分钟,冷却后,在595nm波长下测吸光度,根据所测得的吸光度对照标准曲线求得DNA的质量。
方法步骤
了解—鉴定(紫外吸收法)
原理:核酸类物质含有嘌呤、嘧啶碱基,这些碱基具有共轭双键,在紫外区260nm处有最高吸收峰。紫外吸收法是实验室中最常用的定量测定DNA或RNA的方法。对待测样品的纯度也可用紫外分光光度法进行鉴定。
纯DNA的A260/A280应大于等于1.8,样品中如含有杂蛋白, A260/A280即明显 。
定量测定时,通常以A260值为1相当于50μg/ml 双螺旋DNA,或40μg/ml 单链DNA(或RNA)进行换算。
降低
25
粗提取的DNA中可能含有哪些杂质吗?
可能仍然含有核蛋白、多糖等杂质。
进一步纯化
例如,可以先添加质量分数为25%的SDS溶液,使蛋白质变性后与DNA分开;随后,加入氯仿一异丙醇混合液(体积比为24:1),通过离心将蛋白质及其他杂质除去,取上清液;可重复上述操作几次,直至上清液变成透明的黏稠液体。此外由于苯酚可以迅速使蛋白质变性,抑制核酸酶的活性,因此还可以先用苯酚处理,然后离心分层,这时DNA溶于上层水相,蛋白质变性后存在于酚层中,用吸管、微量移液器等实验用具就可以将两者分开。
CTAB
去除蛋白,多糖,酚类
四.结果分析
27
DNA的粗提取与鉴定
实验原理
DNA不溶于乙醇,蛋白质溶于乙醇
DNA在不同浓度的Nacl溶液中溶解度不同
DNA与二苯胺呈现蓝色反应
DNA的粗提取
选择适宜材料
破碎细胞
DNA的溶解和析出
DNA的纯化
鉴定DNA
与二苯胺混合,沸水浴,呈现蓝色反应
应用
亲子鉴定
应用
核酸检测
应用
精准医疗
传统癌症主要是手术,放疗,化疗,使用其他的抗癌药物,但副作用大,创伤大,不一定完全清除,且在杀死癌细胞的过程的杀死正常细胞,
分析患者的基因信息的基础上精准选择靶向药物
主要就是采集患者生物样本,通过基因测序平台测得患者DNA等分子层面的信息,利用生物信息学进行整合分析,找到与疾病相关的基因突变,形成精确的临床诊断报告
但是面临着问题,生物伦理
30
香蕉中DNA的粗提取实验
①取一段长约2cm的去皮香蕉,剪碎置于玻璃杯中。
②加入10mL温水,2g食盐,5滴洗洁精,充分研磨。
③用双层纱布过滤研磨液,收集滤液。
④向滤液中加人2g嫩肉粉,混合均匀。
⑤将滤液置于55~60°C(木瓜蛋白酶作用的最适温度)的水浴中加热5~10min。
⑥冷却,加入等体积、预冷的体积分数为95%的酒精。
⑦静置2~3min,用玻璃棒(或筷子)挑取白色絮状析出物。
小实验
31
思考每一步加了什么物质,目的是什么
32
THANKAS
Lavf58.20.100
$$