内容正文:
授课章节
第三篇 基因信息传递·第十四章 基因重组与基因工程
授课对象
学时
4
时 间
授课地点
5315、5506、2301教室
教 材
《生物化学》·第六版·人民卫生出版社
教学
目的
要求
1、掌握:基因重组和基因工程的概念,转化作用、限制性核酸内切酶、基因载体、cDNA文库、基因组DNA文库的概念,目的基因的来源,基因载体的类型。
2、熟悉:同源重组、特异位点的基因重组、转座重组的概念和基本过程,重组DNA技术的操作步骤。
3、了解:重组DNA技术与医学的关系,重组DNA技术的操作程序。
教学
重点
难点
1.重点:细菌基因转移的接合作用、转化作用和转导作用,限制性核酸内切酶、基因载体、cDNA文库、基因组DNA文库的概念,目的基因的来源,基因载体的类型。
2.难点:重组DNA技术基本原理和操作步骤。
教学
方法
大课讲授,适当结合临床和生活实际实例
教具
多媒体教学课件
授课
提纲
概述,基因重组与基因工程概念5mins
第一节 DNA的重组
一、同源重组15mins
二、位点特异性重组15mins
三、接合、转化、转导20mins
四、转座20mins
小结 5 mins
第二节 重组DNA技术
一、重组DNA技术相关概念15mins
二、重组DNA技术基因原理25mins
三、重组DNA技术的研究进展15mins
四、重组DNA技术与医学的关系15mins
总结10mins
教 学 主 要 内 容
备 注
一、基因重组和基因工程的概念
1.基因重组概念
基因重组或称遗传重组是指由于不同DNA链的断裂和连接而产生的DNA片段的交换和重新组合,形成新的DNA分子的过程。因此,新的DNA分子中含有原来的两个DNA 分子的片段。严格说来,所有DNA均是重组DNA。在遗传工程中,人们只是设法在试管中改变和连接DNA分子,企图引起基因表达发生比较简单的改变。在这里,人们只是模仿大自然在进化过程中进行的重组和突变而已。
2.基因工程概念
基因工程(genetic engineering)是指采用人工方法将不同来源的DNA进行重组,并将重组后的DNA引入宿主细胞中进行增殖或表达的过程。
二、自然界的基因重组
根据重组的机制和对蛋白质因子的要求不同,可以将狭义的基因重组分为三种类型,即同源重组、位点特异性重组和异常重组。同源重组的发生依赖于大范围的DNA同源序列的联会,在重组过程中,两条染色体或DNA分子相互交换对等的部分。真核生物的非姊妹染色单体的交换、细菌以及某些低等真核生物的转化、细菌的转导接合、噬菌体的重组等都属于这种类型。大肠杆菌的同源重组需要RecA蛋白,类似的蛋白质也存在于其他细菌中。位点特异性重组发生在两个DNA分子的特异位点上。它的发生依赖于小范围的DNA同源序列的联会,重组也只限于这个小范围。两个DNA分子并不交换对等的部分,有时是一个DNA分子整合到另一个DNA分子中。这种重组不需要RecA蛋白的参与。异常重组发生在顺序不相同的DNA分子间,在形成重组分子时往往依赖于DNA的复制而完成重组过程。例如,在转座过程中,转座因子从染色体的一个区段转移到另一个区段,或从一条染色体转移到另一条染色体。这种类型的重组也不需要RecA蛋白的参与。
1、同源重组的概念和机制。
最基本的DNA重组方式,同源重组是指发生在同源序列间的重组,它通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换,又称基因重组。
2、细菌的基因转移与重组
接合作用、转化作用、转化作用。
3、特异位点重组
λ噬菌体DNA的整合,细菌的特异位点重组,免疫球蛋白的基因重排。
4、转座重组
转座子(transposon, Tn)
1950年麦克林托克(McClintock)在对玉米籽粒颜色遗传进行观察时所发现。转座子在移位过程中,导致DNA链的断裂/重接,或是某些基因启动/关闭。
(1)原核细胞转座子
其原型是E.coli的IS(insertion sequence, 插入序列),一个细菌细胞常带少于10个IS序列。IS两端存在着反向重复序列IR(inverted repeat),IR长短不一。IS本身没有任何表型效应,只携带和它转座作用有关的基因,称转座酶基因。
(2)真核细胞转座子
真核细胞中转座子以玉米和果蝇研究最多。玉米中至少有4种影响突变和基因重组的转座子;果蝇中有多个在基因组内随机分布而能重复移动的转座子。而在其他高等生物基因组中都存在与玉米或果蝇转座子相似的序列。真和细胞基因组流动性可能比原核细胞更大。
三、重组DNA技术
1、重组DNA技术相关概念等
(1)概念:
(2)DNA克隆
(3)工具酶
在重组DNA技术中,常需要一些工具酶进行基因操作。如限制性核酸内切酶、连接酶等
(4)目的基因
需要进行克隆的外源基因
(5)基因载体
携带外源基因进行入宿主的特殊DNA,如制裁粒等。
2、重组DNA技术基本原理及操作步骤:
(1)目的基因的获取方法,
人工合成;基因组DNA文库;cDNA文库;聚合酶链式反应。
A.直接从染色体DNA中分离:仅适用于原核生物基因的分离,较少采用。
B.根据已知多肽链的氨基酸顺序,利用遗传密码表推定其核苷酸顺序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。
C.从mRNA合成cDNA:采用一定的方法钓取特定基因的mRNA,再通过逆转录酶催化合成其互补DNA(cDNA),除去RNA链后,再用DNA聚合酶合成其互补DNA链,从而得到双链DNA。这一方法通常可得到可表达的完整基因。
利用PCR合成:
D.如已知目的基因两端的序列,则可采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,在体外合成目的基因。但此法可能会造成克隆的目的基因碱基序列的改变。
(2)克隆载体的选择与构建
(3)目的基因和载体的连接方式
A.粘性末端连接法:当载体DNA和目的基因均用同一种限制酶进行切断时,二者即可带有相同的粘性末端。
B.人工接尾法: 即同聚物加尾连接法。当载体和目的基因无法采用同一种限制酶进行切断,无法得到相同得粘性末端时,可采用此方法。 此法首先使用单链核酸酶将粘性末端切平,再在末端核苷酸转移酶的催化下,将脱氧核糖核苷酸添加于载体或目的基因的3'-端,如载体上添加一段polyG,则可在目的基因上添加一段polyC,故二者即可通过碱基互补进行粘合,再由DNA连接酶连接。
(4)重组DNA的筛选和鉴定
由于重组体导入宿主细胞的比例通常较低,因此需要对含有重组体的宿主细胞进行筛选并作鉴定。可采用以下方法进行:
A.根据重组体的表型进行筛选: 对于带有抗药基因的质粒重组体,可采用插入灭活法进行筛选。如pBR322中带有抗氨苄青霉素和抗四环素基因,当将目的基因插入抗四环素基因后,就可引起该基因失活,细菌对氨苄青霉素耐药,而对四环素敏感。在含氨苄青霉素的培养基上能够生长,而在含四环素的培养基上不能生长的细菌即为带重组体的细菌。
B.根据标志互补进行筛选: 当宿主细胞存在某种基因及其表达产物的缺陷时,可采用此方法筛选重组体。即在载体DNA分子中插入相应的缺陷基因,如宿主细胞重新获得缺陷基因的表达产物,则说明该细胞中带有重组体。
C.根据DNA限制酶谱进行分析: 经过粗筛后的含重组体的细菌,还需进行限制酶谱分析进一步鉴定。将单一细菌进行扩增后分别提取其DNA,用重组时所用的同一限制酶进行酶切,再将其与不含目的基因的载体一起进行电泳比较分析,如发现出现目的基因片段的电泳带即证明重组体中带有目的基因。
D.用核酸杂交法进行分析鉴定:为了进一步鉴定重组基因体中的目的基因,可采用与目的基因部分互补的DNA片段作为探针,与含有重组体的细菌菌落进行杂交,经放射自显影,如结果为阳性,即可确定重组体中带目的基因。
思考题:
1. 什么是同源重组(homologous recombination),其分子机制是什么?
2. 什么是位点特异性重组(site-specific recombination),其分子机制是什么?
3. 什么是转座(transposition),什么是转座子(transposon),原核生物有哪几种基本形式?
4. 什么是DNA重组技术?它包含那些内容?
5. 基因工程(genetic engineering)中,目的基因的获取有哪些方法?
6. 简述基因工程的基本过程。
7. 作为载体的质粒应具备哪些基本条件?
8. 列举常用的基因工程工具酶的特性和用途。
9. 叙述常用的基因工程载体的种类、特点和用途。
10. 怎样能在大肠杆菌中获得真核基因的表达产物?
授课特点
1.首先把第十三章的内容进行概要复习,再结合自然界遗传进化的规律导入至本篇所要学习的内容,承上启下;
2.先介绍本章内容概要,教学目标和要求,使学生明了本章应该学习哪些内容和重点内容;
3.就相应内容联系临床和生活实例,提高学习兴趣;
4.采用启发式教学,适当提问,启迪学生思维;
5.重点介绍基本概念和基本过程,将难点讲清楚。
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