内容正文:
测序技术概述
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基因测序技术的发展史
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基因测序技术的发展史
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1. 概述:
又叫 “双脱氧链终止法测序”,
由英国生物化学家 Frederick Sanger 及其同事于 1977 年发明。
优点:①具有 99.999% 碱基准确率,是DNA序列测定的“金标准”。
②可以对长达1000bp的DNA片段进行测序
③用时短,只需要几十分钟即可完成一次测序
缺点:试剂昂贵,通量低、成本高
一代DNA测序技术——Sanger测序
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一代DNA测序技术——Sanger测序
+模板链
+DNA 聚合酶
+dNTPs
+单引物(同位素标记)
准备四个反应混合物
ddNTP不含3’-OH,无法和下一个核苷酸之间形成磷酸二酯键,DNA链终止延伸。
2. 原理 ①反应系统
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一代DNA测序技术——Sanger测序
2. 原理
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3. 优化
一代DNA测序技术——Sanger测序
①采用4种不同颜色的荧光染料来标记四种双脱氧核苷酸,代替了之前的同位素标记引物方法,那么在一个反应管中可同时进行四个终止反应。
②利用聚丙烯酰胺凝胶分离终止反应的产物后,采用计算机荧光检测系统读取四种双脱氧核苷酸终止子,提高了测序的速度。
③后美国应用生物系统(Applied Biosystems,ABI)推出第一款半自动的ABI370测序仪。并且采用毛细管电泳替代了平板凝胶电泳,提升了分析速度,实现自动化,提高了检测通量。
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一代DNA测序技术——Sanger测序
4. 实例
Chr4:153249393:FBXW7:G:A
GAAGTATGCCC
验证基因突变位点
Refseq:
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二代DNA测序技术——下一代测序/高通量测序技术
1.概述:
代表的技术有: ①Roche公司的454焦磷酸测序技术、
②Illumina公司的Solexa技术
③ABI公司的SOLiD技术
优点:①更高的测序深度带来更高的灵敏度(低至1%)
②探索能力更强
③突变分辨率更高
④相同的DNA起始量产生更多的数据
⑤样本通量更高
缺点:①对少量靶点(1–20个)的测序不够经济、快速
②读长短
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二代DNA测序技术——下一代测序/高通量测序技术
2. 原理 Illumina 测序
DNA分离
文库制备
测序
数据分析
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二代DNA测序技术——下一代测序/高通量测序技术
2. 原理 Illumina 测序
文库制备
DNA片段化—末端修复—A尾添加—接头连接—分选纯化
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二代DNA测序技术——下一代测序/高通量测序技术
2. 原理 Illumina 测序
经“桥式扩增”,以产生单链 DNA 分子的克隆簇
测序仪:Illumina平台
平台的测序技术为基于基因芯片的边合成边测序。
整个平台可解剖为三个系统:
①温度控制系统,原理和普通PCR仪一样,来控制反应的进行;
②酶控制系统,通过各种酶来控制DNA合成与剪切;
③荧光信号收集系统,可以理解为分辨率极高的照相机。
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二代DNA测序技术——下一代测序/高通量测序技术
使用可逆终止化学对 DNA 一次一个碱基进行测序
测序引物与通用接头或索引接头结合,并添加一个用特定荧光颜色标记的碱基。因为克隆簇包含相同的 DNA 序列,所以整个簇被读取为一个碱基。相机记录整个流动槽的这些碱基读数。
2. 原理 Illumina 测序
测序仪:Illumina平台
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二代DNA测序技术——下一代测序/高通量测序技术
2. 原理 Illumina 测序
数据分析
高考真题
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高考真题
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高考真题
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高考真题
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高考真题
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高考真题
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