内容正文:
第1节 重组DNA技术的基本工具
第3章 基因工程
怎么能让大肠杆菌产生胰岛素呢?
不同生物在信息传递过程中都遵循中心法则,并共用同一套遗传密码。
1970 史密斯
感受态流感嗜血杆菌
放射性标记的沙门氏噬菌体的DNA
共同孵化
检测噬菌体DNA是否转化进入细菌细胞内
并未检测到放射性标记的噬菌体DNA
噬菌体DNA为什么检测不到了?
1970 史密斯
感受态流感嗜血杆菌
放射性标记的沙门氏噬菌体的DNA
共同孵化
检测噬菌体DNA是否转化进入细菌细胞内
并未检测到放射性标记的噬菌体DNA
噬菌体DNA可能被流感嗜血杆菌降解了
实验一
实验二
噬菌体DNA溶液黏度下降;
细菌自身DNA溶液黏度无变化
(DNA长度越长,溶液黏度越高)
流感嗜血杆菌中可能存在什么物质?
5
1970 史密斯
感受态流感嗜血杆菌
放射性标记的沙门氏噬菌体的DNA
共同孵化
检测噬菌体DNA是否转化进入细菌细胞内
并未检测到放射性标记的噬菌体DNA
噬菌体DNA可能被流感嗜血杆菌降解了
实验一
实验二
噬菌体DNA溶液黏度下降;
细菌自身DNA溶液黏度无变化
(DNA长度越长,溶液黏度越高)
流感嗜血杆菌可能有切断噬菌体DNA的酶
6
任务1:
根据信封A中EcoR1切割DNA分子产生的片段,推测该酶的识别序列及切割位点,并将其填写在活动单上。(请用箭头标出切割位点)
EcoR1
EcoR1
识别序列
回文结构
切割位点
切割位点
识别双链DNA中特定核苷酸序列
在每条单链特定的部位断开磷酸二酯键
磷酸二酯键
限制性内切核酸酶(限制酶)
EcoR1
限制性内切核酸酶(限制酶)
—分子手术刀
黏性末端
根据信封B中限制性内切核酸酶切割DNA分子产生的片段,推测这些序列是由几种限制性内切核酸酶切割?请将这些酶的识别序列及切割位点填写在学习单上(请用前头标出切割位点)。
任务2:
EcoRⅠ
属名Escherichia首字母
种名coli前两个字母
R型菌株
从中分离的第一个限制酶
限制性内切核酸酶名字的由来:
博耶
11
平末端
尝试用剪刀模拟EcoR1切割DNA(信封C),获得目的基因(人胰岛素基因)
任务3
需要将目的基因送入细胞的载体
——“分子运输车”
胰岛素基因
(目的基因)
质粒
独立于拟核外的,小型环状DNA分子。
有复制原点,能自我复制
复制原点
任务4
尝试选择合适的质粒(信封D),将目的基因与所选择的质粒拼接成重组DNA分子。
讨论:
你选择质粒的原因是什么?
只以氢键相连的两个末端是不
是稳定的,如何使重组DNA结构稳定?
目的基因
质粒
重组
DNA分子
质粒1
质粒2
“分子运输车” ——载体
有一个至多个限制酶切割位点,供外源DNA片段(目的基因)插入其中。
具有复制原点,能使目的基因随之复制。
有特殊的标记基因,便于重组DNA的筛选。
1970年
第一个限制酶被发现
1972年
构建重组DNA分子
复制原点
“分子手术刀”
准确切割DNA分子
“分子缝合针”
“分子运输车”
将DNA片段连接起来
将体外重组好的DNA分子导入受体细胞
重组DNA技术所需的三种基本工具:
01
限制性内切核酸酶 — “分子手术刀”
一、限制性内切核酸酶 ——“分子手术刀”
1.来源:
主要是原核生物
简称限制酶
2.种类:
数千种
注意:限制酶不是一种酶,而是一类酶。
一、限制性内切核酸酶 ——“分子手术刀”
1.来源:
主要是原核生物
简称限制酶
2.种类:
数千种
注意:限制酶不是一种酶,而是一类酶。
3.功能:
能够识别双链 DNA 分子的特定核苷酸序列,并使每一条链中特定部位的磷酸二酯键断开。
为什么限制酶不切割原核生物本身的DNA分子?
原核细胞DNA中不存在限制酶的识别序列或能被识别的序列被修饰了。限制酶在原核生物中主要起到切割外源DNA、起防御作用。
特点:专一性
“两个特定”
4.识别序列:
一、限制性内切核酸酶 ——“分子手术刀”
大多数限制酶的识别序列由___个核苷酸组成,也有少数限制酶的识别序列由___个、___个或 的核苷酸组成。
6
4
8
其他数量
识别的序列的特点
①均有一条中心轴线。
②中轴线两侧的双链DNA上的碱基是反向对称重复排列的 ,称为回文序列,即:一条链正向读与另一条链反向读的碱基顺序完全一致。
注意:限制酶识别过程具有方向性
都是从5’→3’开始读
从5’→3’正向读与另一条链从5’→3’反向读的碱基顺序完全一致
一、限制性内切核酸酶 ——“分子手术刀”
6.作用结果:
产生黏性末端、平末端
EcoR Ⅰ
(在G与A之间切割)
中轴线
黏性末端
平末端
Sam Ⅰ
(在G与C之间切割)
黏性末端
黏性末端
识别序列: GAATTC
切割部位: GA之间的磷酸二酯键
形成黏性末端(从5’往3’读): AATT
①形成 个相同(互补)的黏性末端
可断开 个磷酸二酯键
消耗 分子水
2
2
②形成___个游离的磷酸基团
2
③产生___个切口
1
2
黏性末端:
限制酶在它识别序列的中心轴线两侧,将DNA分子的两条链分别切开时,切开的DNA两条单链的切口,带有几个伸出的核苷酸,它们之间正好互补配对,这样的切口是黏性末端。
平末端:
当限制酶从识别序列的中心轴线处切开时,切开的DNA两条单链的切口,是平整的,这样的切口叫平末端。
例:SmaⅠ只能识别CCCGGG序列,并在C和G之间切开。
可断开 个磷酸二酯键
①形成 个相同平末端
消耗 分子水
②形成___个游离的磷酸基团
2
2
2
2
③产生___个切口
1
平末端
C
G
C
C
G
G
G
C
G
C
G
C
5'
3'
3'
5'
C
G
C
C
G
G
G
C
G
C
G
C
BamHⅠ ; EcoRⅠ ;Hind Ⅲ ;BglⅡ 。
【练习】:写出下列限制酶切割形成的黏性末端
GATC
AATT
AGCT
GATC
思考:同种限制酶切割的黏性末端一定相同吗?不同种限制酶切出的黏性末端一定不同吗?
同种限制酶切割产生的黏性末端相同,不同限制酶可能会形成相同的黏性末端
例:限制性EcoRI的识别序列和切点是-G↓AATCC-,补充完整切割过程图:
限制性SmaI的识别序列和切点是-GGG↓CCC-,补充完整切割过程图:
—G
—CTTAA
AATTC—
G—
—GAATTC—
—CTTAAG—
EcoRI
—GGG
—CCC
CCC—
GGG—
—GGGCCC—
—CCCGGG—
Sma I
黏性末端
平末端
两种末端的正确书写
二、限制性内切核酸酶——“分子手术刀”
【思考】请判断:以下黏性末端是由______种限制酶作用产生的。
3
做题技巧:注意观察识别序列和切割位点
①找到切割位点
②补全序列
练习
下图所示的黏性末端属于同一种限制酶切割产生的是( )
C
A①② B①③ C②④ D③④
1.要想获得某个特定性状的基因必须要用限制酶切几个切口?
可产生几个黏性末端?
要切两个切口,产生四个黏性末端。
2.如果把两种来源不同的DNA用同一种限制酶来切割,会怎样呢?
会产生相同的黏性末端
3.限制酶能切开RNA分子的磷酸二酯键吗?
不能。限制酶只能识别并切开双链DNA分子。
二、限制性内切核酸酶——“分子手术刀”
思考:
4.推测限制酶存在于原核生物中的主要作用是什么?
原核生物易受自然界外源DNA的入侵,但生物在长期的进化过程中形成了一套完善的防御机制,以防止外来病原物的侵害。
限制酶就是细菌的一种防御性工具,当外源DNA侵入时,会利用限制酶将外源DNA切割掉,以保证自身的安全。
所以,限制酶在原核生物中主要起到切割外源DNA、使之失效,从而达到保护自身的目的。
二、限制性内切核酸酶——“分子手术刀”
5.为什么限制酶不切割细菌本身的DNA分子?
通过长期的进化,细菌中含有某种限制酶的细胞,其DNA分子中不具备这种限制酶的识别切割序列,或者通过甲基化酶将甲基转移到所识别序列的碱基上,使限制酶不能将其切开。这样,尽管细菌中含有某种限制酶也不会使自身的DNA被切断,并且可以防止外源DNA的入侵。
思考:
1、下图表示限制酶切割某DNA的过程,从图中可知,该限制酶识别的碱基序列,及切割位点是
A.5'-CTTAAG-3',切点在C和T之间
B.5'-CTTAAG-3',切点在G和A之间
C.5'-GAATTC-3',切点在G和A之间
D.5'-CTTAAC-3',切点在C和T之间
C
练习
2、下面哪项不具有限制酶识别序列的特征
A.GAATTC B.GGGGCCCC
CTTAAG CCCCGGGG
C.CTGCAG D.CTAAATC
GACGTC GATTTAG
D
3.在DNA 测序工作中,需要将某些限制性内切酶的限制位点在 DNA上定位,使其成为 DNA 分子中的物理参照点。这项工作叫做“限制酶图谱的构建”。假设有以下一项实验:用限制酶 HindⅢ,BamHⅠ和二者的混合物分别降解一个 4kb(1kb即1千个碱基对)大小的线性DNA 分子,降解产物分别进行凝胶电泳,在电场的作用下,降解产物分开,如下图所示。据此分析,这两种限制性内切酶在该DNA 分子上的限制位点数目是以下哪一组?
A.HindⅢ1个,BamHⅠ2 个
B.HindⅢ2个,BamHⅠ3个
C.HindⅢ2个,BamHⅠ1 个
D.HindⅢ和BamHⅠ各有2 个
A
练习
02
DNA连接酶 — “分子缝合针”
C
G
G
C
C
G
T
A
T
A
A
T
A
T
G
C
G
C
G
C
T
A
A
T
C
G
T
A
T
A
A
T
A
T
G
C
T
A
T
A
EcoR I
EcoR I
C
G
G
C
C
G
T
T
A
A
A
A
T
T
G
C
G
C
G
C
T
A
A
T
C
G
T
T
A
A
A
A
T
T
G
C
T
A
T
A
C
G
G
C
C
G
T
T
A
A
A
A
T
T
G
C
T
A
T
A
生物A基因片段
生物B基因片段
将不同种来源的DNA片段连接起来
不同来源的DNA片段混合
三、DNA连接酶——“分子缝合针”
1.作用:
将双链DNA片段“缝合”起来,恢复被限制酶切开的两个核苷酸之间的磷酸二酯键。
注意:不是连接氢键
(氢键的形成不需要酶的催化)
2.种类:
类型 E.coli DNA连接酶 T4 DNA连接酶
来源
功能 只缝合____________ 缝合____________和____________
结果 恢复被限制酶切开的两个核苷酸之间的_________________
大肠杆菌
T4噬菌体
黏性末端
黏性末端
平末端
磷酸二酯键
三、DNA连接酶——“分子缝合针”
可把黏性末端之间的缝隙“缝合”起来,
(1)E·coli DNA连接酶或T4DNA连接酶连接黏性末端
即恢复被限制酶切开的两个核苷酸之间的磷酸二酯键
三、DNA连接酶——“分子缝合针”
(2)T4 DNA连接酶连接平末端,效率低
三、DNA连接酶——“分子缝合针”
G
A
G
T
A
T
C
DNA
连接酶
DNA
连接酶
A
T
A
G
T
C
C
G
A
A
T
T
DNA连接酶:连接两个DNA片段
C
A
A
T
T
DNA
聚合酶
DNA聚合酶:以DNA的一条链作为模板,连接游离的脱氧核苷酸,形成磷酸二酯键。
思考:DNA连接酶与DNA聚合酶是一回事吗?为什么?
DNA连接酶、限制酶、 DNA聚合酶、解旋酶、DNA酶的比较
项目 DNA连接酶 限制酶 DNA聚合酶 解旋酶 DNA酶
作用部位
作用对象
作用结果
磷酸二酯键
将DNA片段水解为单个脱氧核苷酸
磷酸二酯键
磷酸二酯键
磷酸二酯键
氢键
DNA片段
DNA
单个的脱氧
核苷酸
DNA
DNA
将两个DNA片段连接成完整的DNA分子
切割双链DNA分子
将单个的脱氧核苷酸连接到DNA单链末端
将双链DNA分子局部解旋为单链
三、DNA连接酶——“分子缝合针”
①限制酶 ②解旋酶 ③DNA连接酶 ④DNA聚合酶 ⑤RNA聚合酶
b
a
A. 切断a处的酶为_______
B. 连接a处的酶为_______
C. 切断b处的酶为_______
①
③④
②
a:磷酸二酯键;b:氢键
练一练:根据所学知识,完成以下填空
你能用DNA连接酶将他们连接起来吗?
2和 3和 ;
1和 ;
4和 。
7
6
5
8
旋转180度
判断两个末端是否为同一种限制酶切割产生的方法:将其中一个末端旋转180度,若与另一个完全相同,则说明两个末端可能是用同一种限制酶切割
三、DNA连接酶——“分子缝合针”
4、限制酶和DNA连接酶是基因工程的工具酶,以下说法正确的是
A.DNA连接酶能将单个核苷酸加到已有的核苷酸片段上形成磷酸二酯键
B.限制酶只能切割双链DNA片段,不能切割烟草花叶病毒的核酸
C.E.coli DNA连接酶既能连接黏性末端,也能连接平末端
D.限制酶主要从原核生物中分离纯化而来,所以原核生物中的限制酶也能剪切自身的DNA
练习
B
5、下列有关基因工程中限制酶的描述,正确的是
A.同种限制酶既可以切割目的基因又可以切割质粒,因此不具备专一性
B.限制酶只能识别和切割DNA,不能识别RNA
C.限制酶与DNA连接酶的作用部位不相同
D.限制酶只能从原核生物中提取
B
一种限制酶能识别双链DNA分子中的特定核苷酸序列,并在特定位点上切割DNA分子,既可以切割目的基因又可以切割质粒,体现了酶的专一性,A错误;限制酶与DNA连接酶的作用部位相同,都是磷酸二酯键,C错误;限制酶主要从原核生物中提取,D错误。
6、如图为DNA分子在不同酶的作用下所发生的变化,图中依次表示限制性内切核酸酶、DNA聚合酶、DNA连接酶、解旋酶作用的正确顺序是
A.①②③④ B.①②④③
C.①④②③ D.①④③②
C
练习
C
A.甲、乙、丙黏性末端分别是由不同的限制酶切割产生的
B.甲、乙具有相同的黏性末端,可形成重组DNA分子,但甲、丙不能
C.DNA连接酶的作用位点是b处
D.切割产生甲的限制酶不能识别由甲、乙黏性末端形成的重组DNA分子片段
7、下列有关如图所示的黏性末端的说法,错误的是
练习
03
基因进入受体细胞的载体 — “分子运输车”
1.载体的作用是什么?
2.有哪些种类?
3.常用的载体是哪种?其有什么特征?
4.作为载体应具备什么条件?
三、基因进入受体细胞的载体——“分子运输车”
作为运载工具,将外源基因送入受体细胞
质粒、噬菌体和动植物病毒
质粒
将 送入受体细胞,在受体细胞内对目的基因进行大量复制。
外源基因
在基因工程中使用的载体包括 等。
质粒、噬菌体和动植物病毒
三、基因进入受体细胞的载体 ——“分子运输车”
1.作用:
2.种类:
3.最常用的载体——质粒
一种裸露的、结构简单、独立于真核细胞细胞核或原核细胞拟核DNA之外,并具有自我复制能力的环状双链DNA分子。
终止子:转录的终点,在转录过程中起调控作用。
启动子: 转录的起点,在转录过程中起调控作用。
复制原点:DNA复制的起始位点。
标记基因
其基因属于细胞质基因。
四、基因进入受体细胞的载体——“分子运输车”
4.运载体需具备的条件:
①在受体细胞中稳定存在并能自我复制
或整合到受体DNA上,随受体DNA同
步复制;
②有一个至多个限制酶切割位点,
便于插入(携带)目的基因;
③具有标记基因,便于筛选含有重组DNA分子的细胞;
④对受体细胞无害、易分离。
真正被用作载体的质粒,都是在天然质粒的基础上进行过人工改造的。
四、基因进入受体细胞的载体——“分子运输车”
知识拓展
标记基因通常有:
①抗生素的抗性基因,如: 抗氨苄青霉素基因(ampr)、抗四环素基因(tetr)
②荧光蛋白基因,如: 绿色荧光蛋白基因(GFP)、红色荧光蛋白基因(RFP)
载体上的标记基因一般是某种抗生素的抗性基因,而受体细胞没有抵抗该抗生素的能力。将含有某抗生素抗性基因的载体携带目的基因导入受体细胞,抗性基因在受体细胞内表达,受体细胞对该抗生素产生抗性。在含有该抗生素的培养基上,能够生存的是被导入了载体的受体细胞。
目的基因是一个DNA片段,不含有复制原点、不含有启动子和终止子。
3.为什么不能直接将目的基因导入受体细胞??
1.质粒上有一个或多个限制酶切点,有什么作用?
思考:
大肠杆菌及质粒结构模式图
供外源基因或外源DNA片段插入其中。
2.质粒上有标记基因,有什么作用?
便于重组DNA的筛选、鉴定和选择。
目的基因不能自主复制,不能稳定存在并遗传给后代。
四、基因进入受体细胞的载体——“分子运输车”
限制酶的选择
1.酶切位点要保证目的基因是完整的
2.酶切位点要要位于启动子和终止子之间(启动子下游)
11、用限制酶EcoRⅤ单独切割某质粒,可产生1个14 kb(1 kb即1 000个碱
基对)的长链,而同时用限制酶EcoRⅤ、MboⅠ联合切割该质粒,可得到
三种长度的DNA片段,见下图(其中*表示EcoR Ⅴ切割后的一个黏性末端)。
若用MboⅠ单独切割该质粒,则产生的DNA片段的长度为
A.2.5 kb和5.5 kb B.2.5 kb和6 kb
C.5.5 kb和8 kb D.6 kb和8 kb
D
练习
解析 用限制酶EcoR Ⅴ单独切割该质粒,可产生1个14 kb(1 kb即1 000个碱基对)的长链,说明该质粒中含有1个EcoRⅤ切割位点;同时用限制酶EcoRⅤ、Mbo Ⅰ联合切割该质粒,可得到三种长度的DNA片段,说明该质粒中含有2个MboⅠ切割位点。但确定MboⅠ的酶切位点时要注意*表示的是EcoRⅤ切割后的黏性末端,则用MboⅠ单独切割该质粒,则产生的DNA片段的长度为6 kb和8(即2.5+5.5)kb,D正确。
54
限制酶
DNA连接酶
载体
①对受体细胞无害;
②有一个至多个限制酶切割位点;
③有特殊的标记基因;
④能自我复制或能整合到宿主DNA上。
质粒、噬菌体 、动植物病毒
基因工程的基本工具
作为载体的条件
种类:
磷酸二酯键
来源 :
主要来源于原核生物
特点:
作用部位:
具有专一性
结果:
形成黏性末端或平末端
连接部位:磷酸二酯键
种类: E.coliDNA连接酶、T4 DNA连接酶
作用: 把两条双链DNA片段拼接起来
课堂小结
提取生物大分子的基本思路:
选用一定的物理或化学方法,分离具有不同物理或化学性质的生物大分子。
五、DNA的粗提取与鉴定
1.实验原理
利用DNA与RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质方面的差异,提取DNA,去除其他成分。
DNA不溶于酒精,
但某些蛋白质溶于酒精
DNA能溶于物质的量浓度为2 mol/L的NaCl溶液
在一定温度下,
DNA被二苯胺试剂染成蓝色
初步分离DNA和蛋白质
溶解DNA
鉴定DNA
五、DNA的粗提取与鉴定
$$