内容正文:
PCR体外扩增仪
微量移液器
电泳结果图
凝胶电泳仪器
3.2.2 DNA片段的扩增及电泳鉴定
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学习目标
1.了解PCR和电泳鉴定的基本原理(科学思维)。
2.认识微量移液器,并学会微量移液器的正确操作(科学探究)。
3.尝试进行PCR的基本操作并用电泳鉴定PCR的产物(科学探究)。
学习重难点
教学重点:
DNA片段的扩增及电泳鉴定。
教学难点:
利用PCR扩增目的基因;
DNA片段的扩增及电泳鉴定。
探究•实践
利用PCR可以在体外进行DNA片段的扩增。PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚和结合;
实验原理:
PCR产物一般通过琼脂糖凝胶电泳鉴定,凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子大小和构象有关;
凝胶中DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下检测出来。
DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷,在电场作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动;
探究•实践
实验目的:
1. 了解PCR和电泳鉴定的基本原理;
2. 尝试进行PCR的基本操作并电泳鉴定PCR的产物。
材料用具:
1.主要仪器用具
PCR仪
微量移液器
核酸电泳装置
吸液枪头
离心管
探究•实践
材料用具:
2.实验试剂:
4种脱氧核苷酸的等量混合液、2种引物、TaqDNA聚合酶、模板DNA、扩增缓冲液、无菌水;电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖和核酸染料等。
PCR试剂盒
琼脂糖
电泳缓冲液
电泳指示剂
探究•实践
实验步骤:
1.用微量移液器按照下列配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分;
10倍浓缩的扩增缓冲液 5uL
20mmol/L的4种脱氧核苷酸等量混合液 1uL
20umol/L的引物I、II 2.5uL
H2O 28~33uL
1~5U/uL的TaqDNA聚合酶 1~2U
模板DNA 5~10uL
总体积 50uL
DNA模板的量为1pg~1ug,如果模板浓度过高,需要进行稀释处理。
探究•实践
实验步骤:
2. 待所有的组分都加入后,盖严离心管的盖子。将微量离心管放入离心机里,离心约10s,使反应液集中在管的底部。
3. 参照下表中的参数,设置好PCR仪的循环程序,将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃,5min — —
30次 94℃,30s 55℃,30s 72℃,1min
最后1次 94℃,1min 55℃,30s 72℃,1min
高温变性使双链彻底打开
将没有配对完成的双链继续配对,补链
探究•实践
实验步骤:
4. 根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量分数为0.8~1.2%的琼脂糖溶液,在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料;
5. 将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
琼脂糖高温熔化才能完全溶解,呈透亮澄清的状态。
加样梳子
凝胶上的加样孔
琼脂糖倒入模具
探究•实践
实验步骤:
6. 待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
7. 将电泳缓冲液加入电泳槽内,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
8. 将扩增的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内,留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物。
第一列为标准参照物
加样操作
探究•实践
实验步骤:
9.接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离设定电压,一般是1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳。
10. 取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
凝胶样品
凝胶成像系统
探究•实践
1.避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头、蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理;
注意事项:
2.实验采购的酶、缓冲液应该进行分装,并在-20℃保存;使用前将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
为什么要进行分装?为何要在冰块上缓慢融化?
避免多次使用,多次冻融,降低酶的活性;分装可以减少酶和缓冲液交叉污染。冰块上缓慢融化可以减少对酶活性的破坏。
3.在微量离心管中添加各种组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
防止交叉污染
探究•实践
1. 你是否成功扩增出DNA片段?判断依据是什么?
分析与评价
可以对扩增的产物进行进行电泳,并将凝胶放在紫外灯下直接观察DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。
2. 你进行电泳鉴定的结果是几条带?如果不止一条带,请分析产生这个结果的可能原因。
如果扩增不成功,可能是:漏加了PCR反应成分,反应成分用量不当,PCR程序设置不当等。如果扩增结