内容正文:
DNA片段的扩增及电泳鉴定
DNA片段的扩增
一、PCR扩增原理
1.PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合; PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器,一次PCR一般要经历30次循环;
2.PCR扩增DNA片段还利用了DNA半保留复制的原理。
10倍浓缩的扩增缓冲液(含Mg2+) 5μL
20mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液(实为dNTP) 1μL
20μmol/L的引物Ⅰ 2.5μL
20μmol/L的引物Ⅱ 2.5μL
H2O 28~33μL
1-5U/μL的Taq DNA聚合酶(即耐高温的DNA聚合酶) 1~2U
模板DNA (用量为1pg-1μg) 5~10μL
总体积 50μL
PCR反应体系的配方
DNA片段的扩增
推动杆
调节旋钮
卸枪头按钮
体积刻度
吸液杆
枪头
(注意:加不同样品时,需要更换枪头)
二、材料用具
①PCR仪(自动控温,实现DNA的扩增)
②微量离心管(进行PCR反应的场所)
③微量移液器
(用于向微量离心管转移PCR配方中的液体)
④一次性吸液枪头(微量移液器吸取
一种试剂更换一次枪头)
DNA片段的扩增
三、方法步骤
DNA片段的扩增
1.移液
2.离心
3.反应
用微量移液器按照配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分。
三、方法步骤
DNA片段的扩增
1.移液
2.离心
3.反应
待所有的组分都加入后,盖严离心管的盖子。
将微量离心管放在离心机上,离心约10 s,使反应液集中在管的底部。(提高反应速率)离心的目的
注:离心管的盖子一定要盖严,防止实验中盖子脱落或液体外溢
三、方法步骤
DNA片段的扩增
1.移液
3.离心
4.反应
将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中,设置程序进行反应。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃,5min / /
30次 94℃,30s 55℃,30s 72℃,1min
最后一次 94℃,1min 55℃,30s 72℃,1min
预变性使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合
三、方法步骤
DNA片段的扩增
扩增1000bp片段一般设定延伸时间设定为1min,故可根据目的基因片段长度适当调整延伸的时间
DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.琼脂糖凝胶电泳原理
①DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。
②迁移动力与方向:在电场的作用下,带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳。
一般DNA分子在一定pH的缓冲液中可以带负电荷,在电场中DNA便向正极端移动
DNA片段的电泳鉴定
PCR的产物一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定。
1.琼脂糖凝胶电泳原理
③迁移速率:在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象有关。
④检测:凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300 nm的紫外灯下被检测出来。
DNA片段的电泳鉴定
2.材料用具
DNA片段的电泳鉴定
电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖和核酸染料等
核酸染料:核酸染料在紫外光照射下发荧光。核酸染料可与DNA分子形成染料-DNA复合物,其荧光强度与DNA含量成正比。
电泳缓冲液:电泳缓冲液用来维持pH值,使DNA带负电。
凝胶载样缓冲液(含指示剂):用于指示DNA样品可能位置
2.材料用具
DNA片段的电泳鉴定
电泳装置(包括电泳仪、电泳槽等)
DNA片段的扩增及电泳鉴定
配制琼脂糖溶液
DNA片段的电泳鉴定
三、方法步骤
根据待分离的DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量分数为0.8%~1.2%的琼脂糖溶液,琼脂糖用沸水浴或微波炉熔化,稍冷却加入适量核酸染料混匀)。
制备凝胶
加样
电泳
观察记录
核酸染料
配制琼脂糖溶液
DNA片段的电泳鉴定
三、方法步骤
制备凝胶
加样
电泳
观察记录
配制琼脂糖溶液
DNA片段的电泳鉴定
三、方法步骤
制备凝胶
加样
电泳
观察记录
①将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
②待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
配制琼脂糖溶液
DNA片段的电泳鉴定
三、方法步骤
制备凝胶
加样
电泳
观察记录
③将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
电泳缓冲液
配制琼脂糖溶液
DNA片段的电泳鉴定
三、方法步骤
制备凝胶
加样
电泳
观察记录
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物(marker)
凝胶载样缓冲液
PCR产物
配制琼脂糖溶液
DNA片段的电泳鉴定
三、方法步骤
制备凝胶
加样
电泳
观察记录
接通电源,根据电泳