内容正文:
第四章
基因工程主要技术及原理
相关连接
内容概要
教学内容
重点提示
思考题
首 页
《基因工程》之
本节课主要涉及基因操作过程中常用的实验方法:
DNA和RNA的提取与纯化
电泳技术
分子杂交技术
相关连接
内容概要
教学内容
重点提示
思考题
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第一节 DNA和RNA的提取与纯化
破碎细胞或包膜-内容物释放
材料准备
核酸分离、纯化
沉淀或吸附核酸,并去除杂质
核酸溶解在适量缓冲液或水中
教学内容
20-60bp
一、基因组DNA的提取与纯化
DNA溶于水,不溶于乙醇、氯仿等有机溶剂
DNA钠盐比游离态更易溶于水
DNP在0.14mol/LNaCl中的溶解度是水中的1%
DNP在1mol/LNaCl中的溶解度是水中的2倍
教学内容
4
生物材料的准备
新鲜,或者冻存的样品
液氮中研磨
加缓冲液
EDTA螯合Mg2+、Ca2+
SDS变性蛋白质
β-巯基乙醇、DTT打开二硫键和抗氧化
PVP与酚和多糖结合及抗氧化
裂解细胞
除杂
加CTAB或SDS结合多糖和蛋白
加酚仿去蛋白
纯化与保存
加乙醇或异丙醇沉淀
加乙醇反洗涤
吹干
水或TE溶解-20℃保存
教学内容
PVP:聚乙烯吡咯烷酮
NVP:乙烯基吡咯烷酮
基因组DNA的提取 --- 酚抽提法
样品的准备
细胞的裂解
蛋白质变性
DNA的抽提
DNA的沉淀
教学内容
血基因组DNA试剂盒
酵母基因组DNA试剂盒
细菌基因组DNA试剂盒
细胞基因组DNA试剂盒
教学内容
CTAB法
流程图
植物材料
裂解液
上层溶液
液氮研磨
抽提
细胞裂解
干燥溶解
离心洗涤
酒精沉淀
DNA溶液
教学内容
CTAB( hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵 )
8
SDS法 流程图 (以动物组织为例)
动物组织
细胞裂解
上层溶液
组织匀浆
抽提
干燥溶解
离心洗涤
酒精沉淀
DNA溶液
教学内容
利用RNP和DNP在盐溶液中溶解度不同,将二者分离
有机溶剂作为蛋白变性剂,同时抑制核酸酶的降解作用
利用不同内容物密度不同的原理分离各种内容物
浓盐法:
有机溶剂抽提法:
密度梯度离心法:
教学内容
10
核酸分离、纯化策略
蛋白质的去除:
酚/氯仿抽提
使用变性剂变性(SDS、异硫氰酸胍等)
高盐洗涤
蛋白酶处理
教学内容
11
多糖的去除:
高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5M NaCl,高盐可溶解多糖。
用多糖水解酶将多糖降解。
在提取缓冲液中加一定量的氯苯(1/2体积),氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖 。
用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500μL DNA液中加入200μl 20% PEG8000 (含1.2 M NaCl) ,冰浴20min。
教学内容
多酚的去除:
在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂:β-巯基乙醇、抗坏血酸、半胱氨酸、二硫苏糖醇等
加入易与酚类结合的试剂:如PVP、PEG(聚乙二醇),它们与酚类有较强的亲和力,可防止酚类与DNA的结合
核酸分离、纯化策略
盐离子的去除:
70%的乙醇洗涤
教学内容
13
CTAB溶液配制好备用,65℃水浴预热。猕猴桃叶片或果实采取后最好立即放到液氮中, 避免酚类物质氧化
65℃水浴一个小时
氯仿:乙醇:异戊醇=80:16:4的抽提液 两次。10000转/分离心20分钟,尽量把丝状物压紧,避免吸取上清时有丝状物牵拉
等体积预冷的异丙醇 ,75%乙醇洗去其他杂质。洗两次 。
用无水乙醇5毫升洗一次。晾干5分钟挥发掉乙醇后加入3-5mL的TE溶解,加入5uL, 1mg/mL的RNA酶后保存
猕猴桃DNA提取实例
CTAB提取缓冲液的改进配方
组份 Tris-HCl (pH8.0) EDTA (pH8.0) NaCl CTAB PVP40 β-巯基乙醇
终浓度 100 mM 20 mM 1.4M 3%(W/V) 5%(W/V) 2%(V/V)使用前加入
教学内容
猕猴桃基因组DNA
教学内容
闭合环状的质粒DNA,在变性后不会分离,复性快;
原理
二、碱裂解法提取质粒DNA
DNA双链
变性
DNA单链
复性
强碱
中性
教学内容
染色体线性DNA和或有缺口的质粒DNA变性后双链分离,难以复性而形成缠绕的结构,与蛋白质—SDS复合物结合在一起;当K+取代Na+时,生成不溶的PDS, 这些复合物从溶液中沉淀下来。
变性
教学内容
利用宿主菌线状染色体DNA与闭环双链质粒DNA的结构状态的差异来提取质粒D