内容正文:
第三章|第二节
DNA片段的扩增及电泳鉴定
第三课时
目
录
CONTENT
DNA片段的扩增及电泳鉴定
01
本章小结及练习
02
实 验
DNA片段的
扩增及电泳鉴定
第三章第二节
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(1)PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合,PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器。
变性
90˚C
延伸
72˚C
退火
50˚C
1. 利用PCR在体外进行DNA片段扩增的原理:
(2)PCR扩增DNA片段还利用了DNA半保留复制的原理。一次PCR一般要经历30次循环。
(一)实验原理
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(1)DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷,在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳。
2. DNA片段电泳鉴定的原理:
(2)PCR的产物一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定。在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象(迁移速率与之呈负相关)等有关。
(3)凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下被检测出来。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(二)材料用具
1. 试剂:
(1)无菌水、琼脂糖
(2)电泳缓冲液(TAE或TBE)
(3)凝胶载样缓冲液(内含指示剂——溴酚蓝)
(4)核酸染料(常用核酸染料为EB即溴化乙锭)
(5)PCR反应体系的配方
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(二)材料用具
1. 试剂:
材料 用量
10倍浓缩的扩增缓冲液(含Mg2+) 5μL
20mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液(实为dNTP) 1μL
20μmol/L的引物Ⅰ 2.5μL
20μmol/L的引物Ⅱ 2.5μL
H2O 28~33μL
1-5U/μL的Taq DNA聚合酶(即耐高温的DNA聚合酶) 1~2U
模板DNA (用量为1pg-1μg) 5~10μL
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(二)材料用具
2. 用具:
(1)PCR仪(自动控温,实现DNA的扩增);
(2)微量离心管(实际上是进行PCR反应的场所);
(3)微量移液器(用于向微量离心管转移PCR配方中的液体);
(4)一次性吸液枪头(微量移液器吸取一种试剂更换一次枪头);
(5)电泳装置(包括电泳仪、电泳槽等)
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(二)材料用具
2. 用具:
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(三)方法步骤
移液
用微量移液器按照PCR反应体系配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分
离心
待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子,将微量离心管放入离心机里,离心约10s,使反应液集中在离心管的底部(提高反应速率)
反应
参照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
1. DNA片段的扩增:
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(三)方法步骤
1. DNA片段的扩增:
可根据目的片段长度适当调整延伸时间
预变性:使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性
94℃,5min
/
/
30次
94℃,30s
55℃,30s
72℃,1min
最后一次
94℃,1min
55℃,30s
72℃,1min
DNA片段的扩增及电泳鉴定
配制琼脂糖溶液
根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀
制备
凝胶
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜
DNA片段的扩增及电泳鉴定
加样
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物
电泳
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳
观察
记录
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相
DNA片段的扩增及电泳鉴定
(四)注意
1. 为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
2. 该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3. 在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
4. 在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
5. PCR扩增不能随