内容正文:
蛋白质的组成单位—氨基酸
水解作用提供了关于蛋白质组成和结构的极有价值的资料
蛋白质可以被酸、碱或蛋白水解酶催化水解
水解过程中,蛋白质逐渐被降解成相对分子质量越来越小的肽片段,直到最后成为游离氨基酸的混合物
根据水解程度,分为完全水解和部分水解
部分水解:产物是大小不等的肽段和氨基酸
完全水解:水解产物是各种氨基酸的混合物
蛋白质
肽片段
游离氨基酸
蛋白质的水解
酸水解
6 mol/L HCl 或4 mol/L H2SO4,回流煮沸20 h左右可使蛋白质完全水解;
蛋白质的组成单位—氨基酸
蛋白质的水解
2、优点:不引起氨基酸消旋,得到的是L-氨基酸
3、缺点:
色氨酸完全被沸酸所破坏
羟基氨基酸(丝氨酸及苏氨酸)有一部分被分解
天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解下来
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碱水解
1、5mol/L NaOH 共煮10~20h,即可使蛋白质完全水解
蛋白质的组成单位—氨基酸
蛋白质的水解
2、优点:色氨酸是稳定的
3、缺点:
碱水解引起精氨酸脱氨,生成鸟氨酸和尿素
水解过程中多数氨基酸遭到不同程度的破坏,并且产生消旋,所得产物是D-和L-氨基酸的混合物,称消旋物
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酶水解
优点:不产生消旋作用,也不破坏氨基酸
缺点:
使用一种酶往往水解不彻底,需几种酶协同作用才能使蛋白质完全水解
酶水解所需时间较长
酶法主要用于部分水解
常用的蛋白酶有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶(糜蛋白酶)以及胃蛋白酶等(获得蛋白质的部分水解产物,用于一级结构分析)
蛋白质的组成单位—氨基酸
蛋白质的水解
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蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的结构通式
常见AA有20种:19+1(脯氨酸,亚氨基酸)
水解释放的AA>20种(修饰)
结构上的共同点:羧基相邻的α-碳原子(Cα)上都有一个氨基,称为α-氨基酸
Cα上还有一个氢原子和R基
AA的区别在于R基的不同
氨基酸(amino acid):分子中既有氨基又有羧基的化合物
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(1)蛋白质中的常见氨基酸
根据R基的极性,及在中性条件下带电荷的情况,分为4类
①非极性R基氨基酸
在水中溶解度小
蛋白质的组成单位—氨基酸
(1)蛋白质中的常见氨基酸
根据R基的极性,及在中性条件下带电荷的情况,分为4类
①非极性R基氨基酸
在水中溶解度小
氨基酸的分类
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(1)蛋白质中的常见氨基酸
根据R基的极性,及在中性条件下带电荷的情况,分为4类
②极性不带电荷的R基氨基酸
易溶于水
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(1)蛋白质中的常见氨基酸
根据R基的极性,及在中性条件下带电荷的情况,分为4类
③极性带负电荷的R基氨基酸
④极性带正电荷的R基氨基酸
His是R基的pKa值在7附近的唯一aa,作为质子供体和受体在许多酶促反应中具有重要作用
第二种分类方法
1.酸性氨基酸 Glu,Asp;侧链基团在中性溶液中解离后带负电荷的氨基酸。
2.碱性氨基酸 His,Arg,Lys;侧链基团在中性溶液中解离后带正电荷的氨基酸。
3.中性氨基酸 侧链基团在中性溶液中不发生解离,因而不带电荷的氨基酸。可分为:
极性氨基酸:Tyr,Cys,Ser,Thr,Asn,Gln,Trp;
非极性氨基酸:Gly,Ala,Val,Leu,Ile,Pro,Phe,Met
蛋白质的组成单位—氨基酸
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(1)蛋白质中的常见氨基酸
20种氨基酸,记:
R基团是亲水or疏水?
三字母缩写和单字母缩写
为了表达蛋白质或多肽结构的需要,氨基酸的名称常常使用三字母的简写符号来表示,有时也用单字母的简写符号来表示,单字母主要用于表示长链多肽的氨基酸顺序
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(1)蛋白质中的常见氨基酸
20种氨基酸,记:
R基团是亲水or疏水
三字母缩写和单字母缩写
为了表达蛋白质或多肽结构的需要,氨基酸的名称常常使用三字母的简写符号来表示,有时也用单字母的简写符号来表示,单字母主要用于表示长链多肽的氨基酸顺序
氨基酸的简写规则
氨基酸的简写规则
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(2)蛋白质中的不常见氨基酸
有的蛋白质中还存在一些不常见的氨基酸,这些氨基酸在蛋白质生物合成中通常没有翻译密码,是蛋白质生物合成后由相应的氨基酸残基经加工修饰形成的
羟基化:Pro(4-羟脯氨酸)和Lys(5-羟赖氨酸)(结缔组织胶原蛋白)
蛋白质的组成单位—氨基酸
氨基酸的分类
(2)蛋白质中的不常见氨基酸
有的蛋白质中还存在一些不常见的氨基酸,这些氨基酸在蛋白质生物合成中通常没有翻译密码,是蛋白质生物合成后由相应的氨基酸残基经加工修饰形成的
羟基化:Pro(4-羟脯氨酸)和Lys(5-羟赖氨酸)