内容正文:
PCR技术中“引物”归类分析
引物相关基础知识:
1.什么叫引物?引物的作用?
2.PCR扩增时需要两种引物的原因是?
3.在引物设计是可以添加限制酶识别序列,在引物的哪一端添加?
4.目标片段的DNA分子经PCR反应循环n次,共需要消耗引物的数量为?
5.运用PCR技术扩增DNA分子时,需经过变性一复性一延伸一重复过程,经过___轮循环后,开始得到完整的双链目的基因,所有产物中只含有一种引物的DNA分子数____; 同时含有两种引物的DNA分子数是?
6.n次循环后,得到目的基因片段数?
7.PCR的过程?每一步的要求?以及作用?
8.若扩增结果不止一条条带,可能原因可能有哪些?
突破一、引物存在的必要性
1.DNA复制为什么需要引物?
课前反馈:(1)PCR反应体系中含有热稳定DNA聚合酶,下面的表达式________(能、不能)正确反映DNA聚合酶的功能,这是因为_______________。
(2)若用PCR技术扩增HMA3基因,需要分别在不同的PCR扩增仪中加入_________种引物,其作用是_____________ ________ ___。利用PCR技术扩增基因HMA3时,设计引物序列的主要依据是_________ _____。
(1)不能 DNA聚合酶只能将单个脱氧核苷酸连续结合到已有的引物链(DNA单链)上 (2)2 使DNA聚合酶(Taq酶)从引物的3´端开始连接脱氧核苷酸 HMA3基因两端的部分核苷酸序列。
突破一、引物存在的必要性
例1、为研究水稻D基因的功能,研究者将T-DNA插入到D基因中,致使该基因失活,失活后的基因记为d。
(1)运用农杆菌转化法时,为鉴定筛选出的(农杆菌)菌落中是否含有正确插入目的基因的重组质粒,拟设计引物进行PCR鉴定。图2所示为甲、乙、丙3条引物在正确重组质粒中的相应位置,PCR鉴定时应选择的一对引物是__________。某学生尝试用图中另外一对引物从某一菌落的质粒中扩增出了400bp片段,原因是_______________。
乙 丙
目的基因的反向连接
随机选取F2植株若干,提取各植株的总DNA。分别用引物“Ⅰ+Ⅲ”组合及“Ⅱ+Ⅲ”组合进行PCR,检测是否扩增。
若两种引物组合均可完成扩增,则相应植株的基因型为Dd;
若只有“Ⅰ+Ⅲ”组引物可完成扩增,则相应植株的基因型为dd;
若只有“Ⅱ+Ⅲ”组引物可完成扩增,则相应植株的基因型为DD;
(2)(改编题)现以野生植株和突变植株作为亲本进行杂交实验,为探究F2植株基因型。研究者根据D基因,T-DNA的序列,设计了3种引物,如图所示。请利用PCR技术设计实验,写出实验思路和预期试验结果。(提示:完整的T-DNA过大,不能完成PCR)
思维拓展1:
1.若构建基因表达载体时,基因反接,可抑制相关基因的表达,简述其原理。
2.选择下图中的引物__________组合可扩增出两侧的未知序列。
小结:PCR扩增两引物之间的序列
通过引物可以来检测目的基因是否插入到质粒上
转录出的mRNA与原mRNA碱基互补配对,抑制基因的翻译过程
①④
引物设计一般要遵循以下原则:
(1)典型的引物长度为18-30个碱基。短的引物(15个核苷酸以下)能非常高效地结合---但是它们的专一性 。非常长的引物能提高专一性,但是退火效率 ,从而导致PCR产物量 。
(2)引物设计应避免两个引物互补结合。
(3)引物本身不能折叠配对
差
低
低
突破二、引物的设计与应用
(3)第一组:引物Ⅰ和引物Ⅱ局部发生碱基互补配对而失效
第二组:引物Ⅰ′自身折叠后会出现局部碱基互补配对而失效 (4) 防止DNA变性 保持Taq酶活性所需温度条件
复性(退火) B
(5) 16a 2a(235-1) 15/16 三
课前反馈:(3)设计引物是PCR技术关键步骤之一。某同学在对基因HMA3进行PCR扩增时设计的两组引物(只标注了部分碱基序列)都不合理(如下图),请分别说明理由。
(4)从红景天细胞中提取总RNA为模板,进行RT-PCR。其中PCR的反应条件:98 ℃10 s,55 ℃30 s,72 ℃1 min,35个循环,延伸阶段选用72℃而非95℃综合考虑了两个因素,这两个因素是_____________和___________。其中55 ℃30 s过程称为________。此过程中温度必须根据引物的碱基数量和种类来设定。下表为根据模